TY - JOUR

T1 - Вклад интрона, сохраняемого в транскрипте гена Nxf1, в филогению отряда Chiroptera

AU - Бондарук, Дмитрий Денисович

AU - Голубкова, Елена Валерьевна

AU - Мамон, Людмила Андреевна

PY - 2022

Y1 - 2022

N2 - Ген Nxf1 (nuclear export factor) кодирует основной ядерно-цитоплазматический экспортер мРНК, имеющийся у всех представителей Opisthokonta. Эволюционно-консервативная особенность гена Nxf1 - существование альтернативного транскрипта, сохраняющего определенный интрон. Мы назвали этот интрон кассетным, поскольку он входит в состав эволюционно-консервативной кассеты: предшествующий интрону экзон 110 п. н. - интрон - следующий экзон 37 п. н. Сравнение филогенетических взаимоотношений, устанавливаемых на основании различных вариантов последовательностей гена Nxf1, может способствовать пониманию функциональной значимости последовательности кассетного интрона. Проведено сравнение филогенетических взаимоотношений на основании восьми вариантов последовательности гена Nxf1 для 17 представителей отряда Chiroptera. Филогенетические деревья, построенные на основе полной последовательности гена Nxf1, в наибольшей степени соответствуют современным представлениям об эволюции отряда Chiroptera. Использование последовательностей гена Nxf1, включающих только экзоны или только интроны, приводит к неодинаковой потере точности в установлении эволюционного родства и появлению неразрешенных узлов ветвления филогенетических деревьев. Последовательности, включающие все экзоны плюс кассетный интрон, дают такой же результат, как и полная последовательность гена Nxf1. Полученные результаты свидетельствуют о значимости кассетного интрона в эволюции гена Nxf1 у представителей Chiroptera.

AB - Ген Nxf1 (nuclear export factor) кодирует основной ядерно-цитоплазматический экспортер мРНК, имеющийся у всех представителей Opisthokonta. Эволюционно-консервативная особенность гена Nxf1 - существование альтернативного транскрипта, сохраняющего определенный интрон. Мы назвали этот интрон кассетным, поскольку он входит в состав эволюционно-консервативной кассеты: предшествующий интрону экзон 110 п. н. - интрон - следующий экзон 37 п. н. Сравнение филогенетических взаимоотношений, устанавливаемых на основании различных вариантов последовательностей гена Nxf1, может способствовать пониманию функциональной значимости последовательности кассетного интрона. Проведено сравнение филогенетических взаимоотношений на основании восьми вариантов последовательности гена Nxf1 для 17 представителей отряда Chiroptera. Филогенетические деревья, построенные на основе полной последовательности гена Nxf1, в наибольшей степени соответствуют современным представлениям об эволюции отряда Chiroptera. Использование последовательностей гена Nxf1, включающих только экзоны или только интроны, приводит к неодинаковой потере точности в установлении эволюционного родства и появлению неразрешенных узлов ветвления филогенетических деревьев. Последовательности, включающие все экзоны плюс кассетный интрон, дают такой же результат, как и полная последовательность гена Nxf1. Полученные результаты свидетельствуют о значимости кассетного интрона в эволюции гена Nxf1 у представителей Chiroptera.

KW - NUCLEAR EXPORT FACTOR (NXF)

KW - интрон-содержащие транскрипты

KW - филогенетика

KW - ЭВОЛЮЦИОННО-КОНСЕРВАТИВНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ

KW - РУКОКРЫЛЫЕ

KW - Chiroptera

KW - INTRON-CONTAINING TRANSCRIPTS

KW - phylogenetics

KW - EVOLUTIONARY CONSERVATIVE SEQUENCES

KW - bats

UR - https://www.elibrary.ru/item.asp?id=49751658

M3 - статья

VL - 20

SP - 73

EP - 88

JO - ЭКОЛОГИЧЕСКАЯ ГЕНЕТИКА

JF - ЭКОЛОГИЧЕСКАЯ ГЕНЕТИКА

SN - 1811-0932

IS - 2

ER -