Обоснование. Генетика человека является одним из факторов, определяющих тяжесть течения COVID-19. Ранее в широкомасштабном полногеномном исследовании ассоциаций COVID-19 HG project (COVID-19 Host Genetics Initiative, 2021), рассматривалась связь генетических вариантов, включающих множество локусов, с тяжестью течения COVID-19. Ожидается, что генетические варианты, оказывающие наибольшее влияние на тяжесть течения COVID-19, будут иметь низкую частоту в популяции. Таким образом, изучение редких вариантов может дать дополнительные сведения о патогенезе заболевания и, следовательно, помочь в разработке способов профилактики и лечения. Цель — проведение репликационного анализа для поиска генов, обогащенных редкими генетическими вариантами в отношении тяжести течения COVID-19. Методы. В данном исследовании было проведено секвенирование клинического экзома российской когорты пациентов на базе СПб ГБУЗ «Городская больница № 40» и СПбГУ. В исследовании использовался биоматериал пациентов, госпитализированных в СПб ГБУЗ «Городская больница № 40» с диагнозом COVID-19, и здоровые люди, вошедшие в группу популяционного контроля. Тяжесть течения COVID-19 определялась по результатам компьютерной томографии легких. Список генов для последующей репликации был сформирован в результате анализа литературы. Репликационный анализ генов, ассоциированных с тяжестью течения COVID-19, был выполнен с помощью методов нагрузочного тестирования (burden test). Результаты. Было проведено секвенирование 701 клинического экзома: 263 пациентов с тяжелым течением COVID-19 и 438 здоровых испытуемых. В результате анализа литературы было найдено 18 генов, ассоциированных с тяжелым течением COVID-19, которые вошли в репликационный анализ. Репликационный анализ не выявил генов, ассоциация которых с тяжелым течением COVID-19 подтвердилась бы на исследуемой когорте. Заключение. Несмотря на то, что генов, для которых была бы найдена значимая ассоциация между обогащением функциональными вариантами и тяжестью течения COVID-19, обнаружено не было, рассчитанное направление корреляционной связи совпадает с данными ранее проведенных исследований. Малый размер анализируемой выборки является очевидным ограничением нашего исследования. Расширение исследуемой когорты приведет к усилению мощности тестов и позволит обнаружить дополнительные редкие варианты, влияющие на тяжесть течения COVID-19.
Translated title of the contributionExome-wide association study for replication of rare variants affecting the severity of COVID-19 in the Russian population
Original languageRussian
JournalГены и клетки
Volume19
Issue number2
Early online date24 May 2024
DOIs
StateE-pub ahead of print - 24 May 2024

ID: 119998468