Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Анализ событий альтернативного сплайсинга в кончиках корней и клубеньках Pisum sativum L. / Зорин, Е.А.; Кулаева, О.А.; Афонин, А.М.; Жуков , В.А.; Тихонович, И.А.
In: ЭКОЛОГИЧЕСКАЯ ГЕНЕТИКА, Vol. 17, No. 1, 2019, p. 53-63.Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
}
TY - JOUR
T1 - Анализ событий альтернативного сплайсинга в кончиках корней и клубеньках Pisum sativum L
AU - Зорин, Е.А.
AU - Кулаева, О.А.
AU - Афонин, А.М.
AU - Жуков , В.А.
AU - Тихонович, И.А.
PY - 2019
Y1 - 2019
N2 - Горох посевной (Pisum sativum L.) способен вступать в симбиотические отношения с азотфиксирующими бактериями из группы ризобий (Rhizobia). В обмен на питательные вещества бактерии поставляют фиксированный азот, необходимый для поддержания роста растения. Фиксация азота происходит в специализированных органах - клубеньках. Формирование и функционирование клубенька - сложноорганизованный процесс, требующий тонкой регуляции работы генов. Один из ее механизмов - альтернативный сплайсинг (АС). На данный момент информация о роли АС в установлении и поддержании симбиотических отношений между азотфиксирующими бактериями и бобовыми растениями практически отсутствует, но известно, что это мощный способ регуляции разнообразия протеома клетки, а потому АС наблюдается в реакциях на присутствие микросимбионта. В рамках работы был проведен анализ событий АС в клубеньках и кончиках корней гороха посевного. Показано, что среди функциональных групп генов, демонстрирующих события АС, одной из наиболее представленных является группа, принимающая участие в стрессовых реакциях растения на патогены. Вероятно, транскрипты с удержанным интроном подвергаются воздействию NMD-системы либо меняют свою функцию вследствие изменения первичной и вторичной структуры. Также выявлена in silico, экспериментально подтверждена и оценена количественно с применением метода ПЦР в реальном времени представленность мРНК изоформ четырех генов гороха: PsIGN1, PsSIP1, PsPR-10, PsWRKY40.
AB - Горох посевной (Pisum sativum L.) способен вступать в симбиотические отношения с азотфиксирующими бактериями из группы ризобий (Rhizobia). В обмен на питательные вещества бактерии поставляют фиксированный азот, необходимый для поддержания роста растения. Фиксация азота происходит в специализированных органах - клубеньках. Формирование и функционирование клубенька - сложноорганизованный процесс, требующий тонкой регуляции работы генов. Один из ее механизмов - альтернативный сплайсинг (АС). На данный момент информация о роли АС в установлении и поддержании симбиотических отношений между азотфиксирующими бактериями и бобовыми растениями практически отсутствует, но известно, что это мощный способ регуляции разнообразия протеома клетки, а потому АС наблюдается в реакциях на присутствие микросимбионта. В рамках работы был проведен анализ событий АС в клубеньках и кончиках корней гороха посевного. Показано, что среди функциональных групп генов, демонстрирующих события АС, одной из наиболее представленных является группа, принимающая участие в стрессовых реакциях растения на патогены. Вероятно, транскрипты с удержанным интроном подвергаются воздействию NMD-системы либо меняют свою функцию вследствие изменения первичной и вторичной структуры. Также выявлена in silico, экспериментально подтверждена и оценена количественно с применением метода ПЦР в реальном времени представленность мРНК изоформ четырех генов гороха: PsIGN1, PsSIP1, PsPR-10, PsWRKY40.
KW - горох посевной
KW - симбиоз
KW - АЛЬТЕРНАТИВНЫЙ СПЛАЙСИНГ
KW - ТРАНСКРИПТОМИКА
KW - pea (Pisum sativum L
KW - symbiosis
KW - alternative splicing
KW - transcriptomics
UR - https://www.elibrary.ru/item.asp?id=37282478
M3 - статья
VL - 17
SP - 53
EP - 63
JO - ЭКОЛОГИЧЕСКАЯ ГЕНЕТИКА
JF - ЭКОЛОГИЧЕСКАЯ ГЕНЕТИКА
SN - 1811-0932
IS - 1
ER -
ID: 49493564