Standard

Анализ событий альтернативного сплайсинга в кончиках корней и клубеньках Pisum sativum L. / Зорин, Е.А.; Кулаева, О.А.; Афонин, А.М.; Жуков , В.А.; Тихонович, И.А.

In: ЭКОЛОГИЧЕСКАЯ ГЕНЕТИКА, Vol. 17, No. 1, 2019, p. 53-63.

Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

Harvard

Зорин, ЕА, Кулаева, ОА, Афонин, АМ, Жуков , ВА & Тихонович, ИА 2019, 'Анализ событий альтернативного сплайсинга в кончиках корней и клубеньках Pisum sativum L', ЭКОЛОГИЧЕСКАЯ ГЕНЕТИКА, vol. 17, no. 1, pp. 53-63.

APA

Зорин, Е. А., Кулаева, О. А., Афонин, А. М., Жуков , В. А., & Тихонович, И. А. (2019). Анализ событий альтернативного сплайсинга в кончиках корней и клубеньках Pisum sativum L. ЭКОЛОГИЧЕСКАЯ ГЕНЕТИКА, 17(1), 53-63.

Vancouver

Author

Зорин, Е.А. ; Кулаева, О.А. ; Афонин, А.М. ; Жуков , В.А. ; Тихонович, И.А. / Анализ событий альтернативного сплайсинга в кончиках корней и клубеньках Pisum sativum L. In: ЭКОЛОГИЧЕСКАЯ ГЕНЕТИКА. 2019 ; Vol. 17, No. 1. pp. 53-63.

BibTeX

@article{3aa9407a405c42b8b631d76c1ebde7e8,
title = "Анализ событий альтернативного сплайсинга в кончиках корней и клубеньках Pisum sativum L",
abstract = "Горох посевной (Pisum sativum L.) способен вступать в симбиотические отношения с азотфиксирующими бактериями из группы ризобий (Rhizobia). В обмен на питательные вещества бактерии поставляют фиксированный азот, необходимый для поддержания роста растения. Фиксация азота происходит в специализированных органах - клубеньках. Формирование и функционирование клубенька - сложноорганизованный процесс, требующий тонкой регуляции работы генов. Один из ее механизмов - альтернативный сплайсинг (АС). На данный момент информация о роли АС в установлении и поддержании симбиотических отношений между азотфиксирующими бактериями и бобовыми растениями практически отсутствует, но известно, что это мощный способ регуляции разнообразия протеома клетки, а потому АС наблюдается в реакциях на присутствие микросимбионта. В рамках работы был проведен анализ событий АС в клубеньках и кончиках корней гороха посевного. Показано, что среди функциональных групп генов, демонстрирующих события АС, одной из наиболее представленных является группа, принимающая участие в стрессовых реакциях растения на патогены. Вероятно, транскрипты с удержанным интроном подвергаются воздействию NMD-системы либо меняют свою функцию вследствие изменения первичной и вторичной структуры. Также выявлена in silico, экспериментально подтверждена и оценена количественно с применением метода ПЦР в реальном времени представленность мРНК изоформ четырех генов гороха: PsIGN1, PsSIP1, PsPR-10, PsWRKY40.",
keywords = "горох посевной, симбиоз, АЛЬТЕРНАТИВНЫЙ СПЛАЙСИНГ, ТРАНСКРИПТОМИКА, pea (Pisum sativum L, symbiosis, alternative splicing, transcriptomics",
author = "Е.А. Зорин and О.А. Кулаева and А.М. Афонин and В.А. Жуков and И.А. Тихонович",
year = "2019",
language = "русский",
volume = "17",
pages = "53--63",
journal = "ЭКОЛОГИЧЕСКАЯ ГЕНЕТИКА",
issn = "1811-0932",
publisher = "Эко-Вектор",
number = "1",

}

RIS

TY - JOUR

T1 - Анализ событий альтернативного сплайсинга в кончиках корней и клубеньках Pisum sativum L

AU - Зорин, Е.А.

AU - Кулаева, О.А.

AU - Афонин, А.М.

AU - Жуков , В.А.

AU - Тихонович, И.А.

PY - 2019

Y1 - 2019

N2 - Горох посевной (Pisum sativum L.) способен вступать в симбиотические отношения с азотфиксирующими бактериями из группы ризобий (Rhizobia). В обмен на питательные вещества бактерии поставляют фиксированный азот, необходимый для поддержания роста растения. Фиксация азота происходит в специализированных органах - клубеньках. Формирование и функционирование клубенька - сложноорганизованный процесс, требующий тонкой регуляции работы генов. Один из ее механизмов - альтернативный сплайсинг (АС). На данный момент информация о роли АС в установлении и поддержании симбиотических отношений между азотфиксирующими бактериями и бобовыми растениями практически отсутствует, но известно, что это мощный способ регуляции разнообразия протеома клетки, а потому АС наблюдается в реакциях на присутствие микросимбионта. В рамках работы был проведен анализ событий АС в клубеньках и кончиках корней гороха посевного. Показано, что среди функциональных групп генов, демонстрирующих события АС, одной из наиболее представленных является группа, принимающая участие в стрессовых реакциях растения на патогены. Вероятно, транскрипты с удержанным интроном подвергаются воздействию NMD-системы либо меняют свою функцию вследствие изменения первичной и вторичной структуры. Также выявлена in silico, экспериментально подтверждена и оценена количественно с применением метода ПЦР в реальном времени представленность мРНК изоформ четырех генов гороха: PsIGN1, PsSIP1, PsPR-10, PsWRKY40.

AB - Горох посевной (Pisum sativum L.) способен вступать в симбиотические отношения с азотфиксирующими бактериями из группы ризобий (Rhizobia). В обмен на питательные вещества бактерии поставляют фиксированный азот, необходимый для поддержания роста растения. Фиксация азота происходит в специализированных органах - клубеньках. Формирование и функционирование клубенька - сложноорганизованный процесс, требующий тонкой регуляции работы генов. Один из ее механизмов - альтернативный сплайсинг (АС). На данный момент информация о роли АС в установлении и поддержании симбиотических отношений между азотфиксирующими бактериями и бобовыми растениями практически отсутствует, но известно, что это мощный способ регуляции разнообразия протеома клетки, а потому АС наблюдается в реакциях на присутствие микросимбионта. В рамках работы был проведен анализ событий АС в клубеньках и кончиках корней гороха посевного. Показано, что среди функциональных групп генов, демонстрирующих события АС, одной из наиболее представленных является группа, принимающая участие в стрессовых реакциях растения на патогены. Вероятно, транскрипты с удержанным интроном подвергаются воздействию NMD-системы либо меняют свою функцию вследствие изменения первичной и вторичной структуры. Также выявлена in silico, экспериментально подтверждена и оценена количественно с применением метода ПЦР в реальном времени представленность мРНК изоформ четырех генов гороха: PsIGN1, PsSIP1, PsPR-10, PsWRKY40.

KW - горох посевной

KW - симбиоз

KW - АЛЬТЕРНАТИВНЫЙ СПЛАЙСИНГ

KW - ТРАНСКРИПТОМИКА

KW - pea (Pisum sativum L

KW - symbiosis

KW - alternative splicing

KW - transcriptomics

UR - https://www.elibrary.ru/item.asp?id=37282478

M3 - статья

VL - 17

SP - 53

EP - 63

JO - ЭКОЛОГИЧЕСКАЯ ГЕНЕТИКА

JF - ЭКОЛОГИЧЕСКАЯ ГЕНЕТИКА

SN - 1811-0932

IS - 1

ER -

ID: 49493564