Секвенирование и анализ транскриптома апексов побегов равноспорового плауна Huperzia selago (Lycopodiales) выявили экспрессию гомологов меристемспецифичных генов из семейства KNOX, отсутствие экспрессии “листовых” генов из семейства ARP и наличие экспрессии гена, коди- рующего гомолог “листового” ТФ из семейства YABBY – HsYABBY. На основании того, что гомологи YABBY не обнаружены в геноме единственного секвенированного высшего спорового растения – Selaginella moelendorfii, – сформировалась точка зрения о том, что они являются уникальными для семенных растений (Floyd, Bowman, 2006). Таким образом, гомологи гена YABBY у споровых расте- ний были впервые выявлены нами (Evkaikina et al, 2017). Поиск гомологов ТФ YABBY в транскрип- томах других плаунообразных Lycopodium deuterodensum, Isoetes tegetiformans, Selaginella apoda, Selaginella kraussiana в базе данных OneKP (www.onekp.com) не дал результатов, что делает HsYABBY уникальным для споровых растений. Филогенетический анализ показал, что ген HsYABBY является сестринским по отношению к генам YABBY остальных растений, и, вероятно, гены YABBY появились у общего предка всех высших растений (Evkaikina et al., 2017).
Примечательно, что в транскриптоме H. selago (растение с симплексной АМП) отсутствовали транскрипты гомологов ТФ ARP, экспрессия которых была отмечена для разноспорового плауна S. kraussiana (растение с моноплексной АМП) (Harrison et al, 2005). Чтобы проверить предположение, что экспрессия генов, кодирующих ТФ ARP, характерна только для растений с моноплексной АМП, был проведен поиск генов, кодирующих гомологи данной группы ТФ в геномах голосеменных расте- ний с симплексной АМП. Потенциальный ген-гомолог ARP у Picea abies (PaARP) был найден в базе http:// congenie.org. Эти данные показали, что ARP-независимая регуляция не является общей̆ особен- ностью симплексной АМП.