Выполнен DFT-квантово-химический расчет L и D изомеров молекулы триптофана (Trp) и катиона (Trp)+ в газовой фазе и в воде с целью выяснения влияния воды, рассматриваемой в приближении диэлектрического континуума, на электронные характеристики молекулы. Распределение эффективных атомных зарядов и длин связей позволяет предварительно указать на наиболее вероятные участки разрыва химической связи в ходе фрагментации молекулы под воздействием ионизирующего потока частиц. Эти данные дополняются расчетом энергий фрагментации. Из числа возможных изомерных форм в воде выделены цвиттер-ионные структуры, для которых характерно возникновение значительных дипольных моментов и изменение их ориентации по отношению к основному состоянию.