Представители супергруппы Amoebozoa известны как хозяева многочисленных и разнообразных эндобионтов, начиная от водорослей и заканчивая бактериями и вирусами (в том числе – сложными консорциумами из нескольких видов бактерий, глубоко интегрированными в энергетический обмен клетки у архамеб). При этом клетки многих видов амеб могут служить векторами для находящихся в них организмов, которые сохраняются в цитоплазме клеток и в цистах амеб в течение многих лет и в любой момент могут быть выделены клеткой во внешнюю среду. Так, из примерно 500 видов бактерий, потенциально патогенных для человека, более 100 способны сохраняться и размножаться внутри клеток амеб. В клетках амеб обнаруживается широкий спектр вирусов, начиная от гигантского мимивируса (который, как оказалось, может участвовать в развитии пневмонии) и до хорошо известных вирусов, в том числе – патогенных для человека – таких как вирус Коксаки, способный выживать в трофозоитах Acanthamoeba castellanii и сохранять инфекционность не менее 6 месяцев. Из-за этого амеб часто называют «троянскими конями» в мире микробов.
Результаты филогенетических реконструкций показывают, что упомянутый уже мимивирус приобрел многие гены путем горизонтального переноса генов либо от своих амебных хозяев, либо от бактерий, паразитирующих на тех же хозяевах. Это дает основание утверждать, что амебы являются своего рода “плавильными котлами” эволюции, в которых в результате рекомбинации могут возникать различные новые организмы, включая гигантские вирусы со сложным репертуаром генов различного происхождения. Подобный перенос генов приводит к взаимной адаптации и видоизменению генома и амеб, и населяющих их бактерий и вирусов. Какие новые сочетания генов «сварятся» в этом котле, насколько они могут быть опасны, как предотвратить их потенциальное распространение – пока совершенно неясно.
Поддержано РНФ № 24-44-00096 (экспериментальные данные) и СПбГУ № 128785052 (подходы к анализу метагеномных данных).