Протеомика представляет собой один из важнейших инструментов функциональной геномики, позволяющих непосредственно изучать регуляторные механизмы, лежащие в основе развития и старения растений, а также дающих возможность оценить вклад индивидуальных метаболических путей в эти процессы. Таким образом, этот подход идеален для изучения молекулярных механизмов, лежащих в основе мутуалистических растительно-микробных взаимодействий, таких как бобоворизобиальный симбиоз. Поэтому, нами были изучены изменения клубенькового протеома гороха (Pisum sativum) и фасоли (Phaseolus vulgaris), образующих клубеньки недерминированного и детерминированного типа. Белки выделялись из клубеньков ювенильных, цветущих и зрелых растений, и, после протеолиза, полученные гидролизаты анализировалсь методами нанопоточной хроматомасс-спектрометрии высокого разрешения (nanoLC-ESI-Q- и LIT-Orbitrap-MS). Белки и их посттрансляционные модификации (ПТМ) аннотировались с помощью поисковой машины SEQUEST. Относительный количественный анализ был проведен без использования изотопной метки. Анализ показал выраженные изменения протеома и ПТМ, связанные с возрастом клубеньков.