Пространственная организация генома в интерфазном ядре играет ключевую роль в регуляции экспрессии генов, благодаря тесной взаимосвязи между иерархическими уровнями упаковки генома и его функциональной активностью. Сочетание современных биохимических и биоинформатических подходов позволили идентифицировать в интерфазном ядре хроматиновые нанодомены, в том числе топологически-ассоциированные домены и А/В компартменты. Реорганизация хроматиновых доменов в ходе дифференцировки клеток, в патологическом состоянии и в ответ на различные внешние воздействия остается мало изученной. Значительные усилия также направлены на сопоставление данных, полученных методами визуализации геномных локусов и технологии захвата конформации хроматина. В рамках этой проблемы представляется целесообразными исследование пространственной организации генома с помощью комплексного подхода, сочетающего современные методы HiC и 3D-FISH, на различных модельных объектах. Кроме того, актуальным является исследование механизмов установления специфической архитектуры генома в специализированных типах клеток. Для решения этой задачи представляется важным исследовать роль различных архитектурных белков хроматина в поддержании пространственной организации генома на уровне отдельных хроматиновых доменов.