Предлагаемое исследование является методологически новым, поскольку в нем предполагается преодолеть некоторые дефекты имеющихся подходов к изучению российского православного наследия. Оно также имеет содержательную новизну, связанную с фокусировкой на узловых темах каждого этапа и внимание к ключевым темам всего исторического развития отечественного богословия.

Для достижения поставленной цели коллектив решает задачи а) отбора релевантных источников, б) выявления в выбранных текстах основных богословских (богословско-философских, рационально-теологических) проблем, задающих матрицу создаваемой реконструкции, в) отбора дополнительных источников, необходимых для уточнения созданной матрицы — применительно к каждому из пяти этапов, г) создания поэтапной исторической реконструкции развития отечественной богословской мысли, д) описания роли теологии как отрасли науки в структуре гуманитарного и социального знания, е) формулировки прогностических выводов о ее (теологии) научной и общественной значимости в контексте больших вызовов, ж) обобщенного описания разработанной в ходе выполнения проекта исследовательской методики для дальнейшего применения её в новых научных проектах и преподавательской работе.