К началу 21 века произошел прорыв в понимании механизмов регуляции экспрессии генов и поддержания стабильности генома и, вместе с тем, произошло расширение горизонтов сложности этих механизмов. Этот прорыв связан с ростом исследованний экспресии белок-некодирующей части генома и функций некодирующих РНК. Однако функциональная аннотация длинных нкРНК значительно отстает от таковой для которотких нкРНК, многие из которых отнсоятся к нкРНК «домашнего хозяйства» (малые ядерные, малые ядрышковые, рибосомные, транспортные РНК и т.п.) или к микро-РНК, так как их функции часто определяются способностью комплиментарно взаимодействовать с РНК-мишенью. Предложенная недавно концепция функциональной таксономии длинных нкРНК основывается на наличии структурных элементов, наделяющих РНК определенными функциями. Согласно этой концепции можно выделить три крупных функциональных таксона длинных нкРНК: нкРНК, участвующие в (1) контроле трансляции, (2) эпигенетической регуляции экспрессии генома и (3) поддержании архитектуры клетки. В рамках указанного проекта мы планируем проверить ряд новых гипотез, относящихся к функциям некодирующих белки РНК. Мы предполагаем, что разнообразные длинные некодирующие РНК принимают участие в формировании не ограниченных мембранами ядерных доменов, накапливающих определенные наборы РНП-комплексов в конкретных локусах хромосом.