1. 2025
  2. PCANN Program for Structure-Based Prediction of Protein–Protein Binding Affinity: Comparison With Other Neural-Network Predictors

    Лебеденко, О. О., Половинкин, М. С., Казовская, А. А. & Скрынников, Н. Р., 1 Sep 2025, In: Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. 93, 9, p. 1498-1506 9 p.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  3. Local structure propensities in disordered proteins from cross-correlated NMR spin relaxation

    Braun, D., Kaufmann, C., Beier, A., Ceccolini, I., Лебеденко, О. О., Скрынников, Н. Р. & Konrat, R., 1 Jun 2025, In: Journal of Biomolecular NMR. 79, 2, p. 115–127 13 p.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  4. 2024
  5. ESM-language model and graph attention network for structure-based prediction of protein-protein binding affinity.

    Лебеденко, О. О., Половинкин, М. С., Казовская, А. А. & Скрынников, Н. Р., 5 Dec 2024, p. 114-114. 1 p.

    Research output: Contribution to conferenceAbstractpeer-review

  6. Order/Disorder Transitions Upon Protein Binding: A Unifying Perspective

    Lebedenko, O. O., Sekhar, A. & Скрынников, Н. Р., 1 Dec 2024, In: Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. 92, 12, p. 1459-1463 5 p.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  7. Using NMR spectroscopy and MD modeling for structural and dynamic characterization of flexible H4 tails in nucleosome core particle

    Лебеденко, О. О., Измайлов, С. А., Рабдано, С. О. & Скрынников, Н. Р., 28 Jul 2024, p. 106-111. 425 p.

    Research output: Contribution to conferenceAbstract

  8. Using NMR diffusion data to validate MD models of disordered proteins: test case of N-terminal tail of histone H4.

    Лебеденко, О. О., Саликов, В. А., Измайлов, С. А., Подкорытов, И. С. & Скрынников, Н. Р., 2 Jan 2024, In: Biophysical Journal. 123, 1, p. P80-100 21 p.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  9. PCANN - Protein Complex Affinity Neural Network

    Лебеденко, О. О., Половинкин, М. С. & Скрынников, Н. Р., 2024

    Research output: Non-textual formSoftware

  10. Protein loop reconstruction by combination of MD modeling and crystallographic data

    Ваганова, П. С., Лебеденко, О. О., Михайловский, О. В. & Скрынников, Н. Р., 2024.

    Research output: Contribution to conferenceAbstract

  11. Protein loop reconstruction by using MD simulations and crystallographic data

    Ваганова, П. С., Лебеденко, О. О., Михайловский, О. В. & Скрынников, Н. Р., 2024

    Research output: Non-textual formSoftware

  12. 2023
  13. Conformational and Interaction Landscape of Histone H4 Tails in Nucleosomes Probed by Paramagnetic NMR Spectroscopy

    Sun, W., Lebedenko, O. O., Salguero, N. G., Shannon, M. D., Zandian, M., Poirier, M. G., Skrynnikov, N. R. & Jaroniec, C. P., 22 Nov 2023, In: Journal of the American Chemical Society. 145, 46, p. 25478-25485 8 p.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

Previous 1 2 Next

ID: 43939577