Rp-3’:5’-AMPS блокирует начальные стадии конформационнного перехода регуляторной субъединицы протеинкиназы А Ia; Ч II

О.Н. Рогачева, Б.Ф. Щеголев, В.Е. Стефанов, E.B. Савватеева-Попова

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Аннотация

Методами квантовой химии и лиганд_рецепторного докинга показано, что фосфотиоатный аналог 3':5'_AMP (Rp_3':5'_AMPS) препятствует смещению амидной группы A326, наблюдаемому при переходе B_домена регуляторной субъединицы протеинкиназы A Iα из H_ в B_конформацию, и блокирует таким образом начальные этапы работы гидрофобного переключателя. В соответствии с предложенной гипотезой связывание Rp_3’:5’_AMPS, как и 3':5'_AMP, сопровождается образованием водородной связи с амидной группой A326, однако параметры этой связи в совокупности с положением атома серы делают движение A326 невозможным. В результате Rp_3':5'_AMPS_связанный домен оказывается «запертым» в H_конформации, что и подтверждается данными рентгеноструктурного анализа
Язык оригиналарусский
Страницы (с-по)578-582
ЖурналБИОХИМИЯ
Том77
Номер выпуска5
СостояниеОпубликовано - 2012

Цитировать