Найти результаты исследования

Поиск концепций
Выбранные фильтры

Год публикации

  • 2020
  • 2019
  • 2018
  • 2017
  • 2016
  • 2015
  • 2014
  • 2013
  • 2012
  • 2011

Автор

  • Алла Львовна Лапидус
2012

Permanent draft genome sequence of the gliding predator Saprospira grandis strain Sa g1 (= HR1)

Mavromatis, K., Chertkov, O., Lapidus, A., Nolan, M., Lucas, S., Tice, H., Del Rio, T. G., Cheng, J. F., Han, C., Tapia, R., Bruce, D., Goodwin, L. A., Pitluck, S., Huntemann, M., Liolios, K., Pagani, I., Ivanova, N., Mikhailova, N., Pati, A., Chen, A. и 14 др., Palaniappan, K., Land, M., Brambilla, E. M., Rohde, M., Spring, S., Göker, M., Detter, J. C., Bristow, J., Eisen, J. A., Markowitz, V., Hugenholtz, P., Kyrpides, N. C., Klenk, H. P. & Woyke, T., 12 июл 2012, В : Standards in Genomic Sciences. 6, 2, стр. 210-219 10 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

1 Цитирования (Scopus)

Complete genome sequence of the termite hindgut bacterium Spirochaeta coccoides type strain (SPN1T), reclassification in the genus Sphaerochaeta as Sphaerochaeta coccoides comb. nov. and emendations of the family Spirochaetaceae and the genus Sphaerochaeta

Abt, B., Han, C., Scheuner, C., Lu, M., Lapidus, A., Nolan, M., Lucas, S., Hammon, N., Deshpande, S., Cheng, J. F., Tapia, R., Goodwin, L. A., Pitluck, S., Liolios, K., Pagani, I., Ivanova, N., Mavromatis, K., Mikhailova, N., Huntemann, M., Pati, A. и 17 др., Chen, A., Palaniappan, K., Land, M., Hauser, L., Brambilla, E. M., Rohde, M., Spring, S., Gronow, S., Göker, M., Woyke, T., Bristow, J., Eisen, J. A., Markowitz, V., Hugenholtz, P., Kyrpides, N. C., Klenk, H. P. & Detter, J. C., 12 июл 2012, В : Standards in Genomic Sciences. 6, 2, стр. 194-209 16 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

37 Цитирования (Scopus)

Genome sequence of the orange-pigmented seawater bacterium Owenweeksia hongkongensis type strain (UST20020801T)

Riedel, T., Held, B., Nolan, M., Lucas, S., Lapidus, A., Tice, H., Del Rio, T. G., Cheng, J. F., Han, C., Tapia, R., Goodwin, L. A., Pitluck, S., Liolios, K., Mavromatis, K., Pagani, I., Ivanova, N., Mikhailova, N., Pati, A., Chen, A., Palaniappan, K. и 11 др., Rohde, M., Tindall, B. J., Detter, J. C., Göker, M., Woyke, T., Bristow, J., Eisen, J. A., Markowitz, V., Hugenholtz, P., Klenk, H. P. & Kyrpides, N. C., 7 ноя 2012, В : Standards in Genomic Sciences. 7, 1, стр. 120-130 11 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

9 Цитирования (Scopus)
2011

Complete genome sequence of the filamentous gliding predatory bacterium Herpetosiphon aurantiacus type strain (114-95T)

Kiss, H., Nett, M., Domin, N., Martin, K., Maresca, J. A., Copeland, A., Lapidus, A., Lucas, S., Berry, K. W., del Rio, T. G., Dalin, E., Tice, H., Pitluck, S., Richardson, P., Bruce, D., Goodwin, L., Han, C., Detter, J. C., Schmutz, J., Brettin, T. и 7 др., Land, M., Hauser, L., Kyrpides, N. C., Göker, M., Woyke, T., Klenk, H. P. & Bryant, D. A., 1 янв 2011, В : Standards in Genomic Sciences. 5, 3, стр. 356-370 15 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Открытый доступ
32 Цитирования (Scopus)

Non-contiguous finished genome sequence of the opportunistic oral pathogen Prevotella multisaccharivorax type strain (PPPA20 t)

Pati, A., Gronow, S., Lu, M., Lapidus, A., Nolan, M., Lucas, S., Hammon, N., Deshpande, S., Cheng, J. F., Tapia, R., Han, C., Goodwin, L., Pitluck, S., Liolios, K., Pagani, I., Mavromatis, K., Huntemann, M., Chen, A., Palaniappan, K., Land, M. и 12 др., Hauser, L., Detter, J. C., Brambilla, E. M., Rohde, M., Göker, M., Woyke, T., Bristow, J., Eisen, J. A., Markowitz, V., Hugenholtz, P., Kyrpides, N. C. & Klenk, H. P., 28 окт 2011, В : Standards in Genomic Sciences. 5, 1, стр. 41-49 9 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Открытый доступ
1 Цитирования (Scopus)

Complete genome sequence of oceanithermus profundus type strain (506 T)

Pati, A., Zhang, X., Lapidus, A., Nolan, M., Lucas, S., del Rio, T. G., Tice, H., Cheng, J. F., Tapia, R., Han, C., Goodwin, L., Pitluck, S., Liolios, K., Pagani, I., Mavromatis, K., Chen, A., Palaniappan, K., Hauser, L., Jeffries, C. D., Brambilla, E. M. и 16 др., Röhl, A., Mwirichia, R., Rohde, M., Tindall, B. J., Sikorski, J., Wirth, R., Göker, M., Woyke, T., Detter, J. C., Bristow, J., Eisen, J. A., Markowitz, V., Hugenholtz, P., Kyrpides, N. C., Klenk, H. P. & Land, M., 11 окт 2011, В : Standards in Genomic Sciences. 4, 2, стр. 210-220 11 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Открытый доступ
3 Цитирования (Scopus)
2013

Genome sequence of Frateuria aurantia type strain (Kondô 67T), a xanthomonade isolated from Lilium auratium Lindl.

Anderson, I., Teshima, H., Nolan, M., Lapidus, A., Tice, H., Del Rio, T. G., Cheng, J-F., Han, C., Tapia, R., Goodwin, L. A., Pitluck, S., Liolios, K., Mavromatis, K., Pagani, I., Ivanova, N., Mikhailova, N., Pati, A., Chen, A., Palaniappan, K., Land, M. и 11 др., Rohde, M., Lang, E., Detter, J. C., Göker, M., Woyke, T., Bristow, J., Eisen, J. A., Markowitz, V., Hugenholtz, P., Kyrpides, N. C. & Klenk, H-P., 2013, В : Standards in Genomic Sciences. 9, 1, стр. 83-92

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

2011

Genome sequence of Chthoniobacter flavus Ellin428, an aerobic heterotrophic soil bacterium

Kant, R., van Passe, M. W. J., Palva, A., Lucas, S., Lapidus, A., del Rio, T. G., Dalin, E., Tice, H., Bruce, D., Goodwin, L., Pitluck, S., Larimer, F. W., Land, M. L., Hauser, L., Sangwan, P., de Vos, W. M., Janssen, P. H. & Smidt, H., 1 июн 2011, В : Journal of Bacteriology. 193, 11, стр. 2902-2903 2 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхкомментарий, выступление

28 Цитирования (Scopus)

Complete genome sequence of Cellulophaga lytica type strain (LIM-21 T)

Pati, A., Abt, B., Teshima, H., Nolan, M., Lapidus, A., Lucas, S., Hammon, N., Deshpande, S., Cheng, J. F., Tapia, R., Han, C., Goodwin, L., Pitluck, S., Liolios, K., Pagani, I., Mavromatis, K., Ovchinikova, G., Chen, A., Palaniappan, K., Land, M. и 15 др., Hauser, L., Jeffries, C. D., Detter, J. C., Brambilla, E. M., Kannan, K. P., Rohde, M. F., Spring, S., Göker, M., Woyke, T., Bristow, J., Ei-Sen, J. A., Markowitz, V., Hugenholtz, P., Kyrpides, N. C. & Klenk, H. P., 11 окт 2011, В : Standards in Genomic Sciences. 4, 2, стр. 221-232 12 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

21 Цитирования (Scopus)

Soil microbe Dechloromonas aromatica Str. RCB metabolic analysis

Salinero, K. K., Keller, K., Feil, W. S., Feil, H., Trong, S., Di Bartolo, G. & Lapidus, A., 15 дек 2011, Recent Advances in Microbiology. Apple Academic Press, стр. 120-147 28 стр.

Результат исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийглава/разделнаучнаярецензирование

Complete genome sequence of bacteroides salanitronis type strain (BL78 T)

Gronow, S., Held, B., Lucas, S., Lapidus, A., del Rio, T. G., Nolan, M., Tice, H., Deshpande, S., Cheng, J. F., Pitluck, S., Liolios, K., Pagani, I., Mavromatis, K., Pati, A., Tapia, R., Han, C., Goodwin, L., Chen, A., Palaniappan, K., Land, M. и 14 др., Hauser, L., Chang, Y. J., Jeffries, C. D., Brambilla, E. M., Rohde, M., Göker, M., Detter, J. C., Woyke, T., Bristow, J., Markowitz, V., Hugenholtz, P., Kyrpides, N. C., Klenk, H. P. & Eisen, J. A., 11 окт 2011, В : Standards in Genomic Sciences. 4, 2, стр. 191-199 9 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Открытый доступ
6 Цитирования (Scopus)
2019

Draft Genome Sequence of Mn(II)-Oxidizing Bacterium Oxalobacteraceae sp. Strain AB_14

Bushman, T. J., Akob, D. M., Bohu, T., Beyer, A., Woyke, T., Shapiro, N., Lapidus, A., Klenk, H-P. & Kuesel, K., 24 окт 2019, В : Microbiology resource announcements. 8, 43, e01024-19.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

2011

Complete genome sequence of the thermophilic, hydrogen-oxidizing Bacillus tusciae type strain (T2 T) and reclassification in the new genus, Kyrpidia gen. nov. as Kyrpidia tusciae comb. nov. and emendation of the family alicyclobacillaceae da Costa and Rainey, 2010

Klenk, H. P., Lapidus, A., Chertkov, O., Copeland, A., del Rio, G. T., Nolan, M., Lucas, S., Chen, F., Tice, H., Cheng, J. F., Han, C., Bruce, D., Goodwin, L., Pitluck, S., Pati, A., Mavromatis, K., Daum, C., Chen, A., Palaniappan, K., Chang, Y. J. и 12 др., Land, M., Hauser, L., Jeffries, C. D., Detter, J. C., Rohde, M., Abt, B., Pukall, R., Göker, M., Bristow, J., Markowitz, V., Hugenholtz, P. & Eisen, J. A., 31 окт 2011, В : Standards in Genomic Sciences. 5, 1

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Открытый доступ
28 Цитирования (Scopus)

Complete genome sequence of Hydrogenobacter thermophilus type strain (TK-6 T)

Zeytun, A., Sikorski, J., Nolan, M., Lapidus, A., Lucas, S., Han, J., Tice, H., Cheng, J. F., Tapia, R., Goodwin, L., Pitluck, S., Liolios, K., Mavromatis, K., Ovchinnikova, G., Pati, A., Chen, A., Palaniappan, K., Ngatchou-Djao, O. D., Land, M., Hauser, L. и 15 др., Jeffries, C. D., Han, C., Detter, J. C., Übler, S., Rohde, M., Tindall, B. J., Göker, M., Wirth, R., Woyke, T., Bristow, J., Eisen, J. A., Markowitz, V., Hugenholtz, P., Klenk, H. P. & Kyrpides, N. C., 11 окт 2011, В : Standards in Genomic Sciences. 4, 2, стр. 131-143 13 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Открытый доступ
5 Цитирования (Scopus)
2015

High quality draft genome sequence of leucobacter chironomi strain MM2LB<sup>T</sup> (DSM 19883<sup>T</sup>) isolated from a chironomus sp. egg mass

Laviad, S., Lapidus, A., Copeland, A., Reddy, T. B. K., Huntemann, M., Pati, A., Ivanova, N. N., Markowitz, V. M., Pukall, R., Klenk, H-P., Woyke, T., Kyrpides, N. C. & Halpern, M., 2015, В : Standards in Genomic Sciences. MAY2015, 7 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

2013

Genome sequence of the thermophilic fresh-water bacterium Spirochaeta caldaria type strain (H1(T)), reclassification of Spirochaeta caldaria, Spirochaeta stenostrepta, and Spirochaeta zuelzerae in the genus Treponema as Treponema caldaria comb. nov., Treponema stenostrepta comb. nov., and Treponema zuelzerae comb. nov., and emendation of the genus Treponema

Abt, B., Göker, M., Scheuner, C., Han, C., Lu, M., Misra, M., Lapidus, A., Nolan, M., Lucas, S., Hammon, N., Deshpande, S., Cheng, JF., Tapia, R., Goodwin, LA., Pitluck, S., Liolios, K., Pagani, I., Ivanova, N., Mavromatis, K., Mikhailova, N. и 18 др., Huntemann, M., Pati, A., Chen, A., Palaniappan, K., Land, M., Hauser, L., Jeffries, CD., Rohde, M., Spring, S., Gronow, S., Detter, JC., Bristow, J., Eisen, JA., Markowitz, V., Hugenholtz, P., Kyrpides, NC., Woyke, T. & Klenk, HP., 2013, В : Standards in Genomic Sciences. 8, 1, стр. 88–105

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

21 Цитирования (Scopus)
2014

High quality draft genome sequence of Olivibacter sitiensis type strain (AW-6(T)), a diphenol degrader with genes involved in the catechol pathway

Ntougias, S., Lapidus, A., Han, J., Mavromatis, K., Pati, A., Chen, A., Klenk, H-P., Woyke, T., Fasseas, C., Kyrpides, N. C. & Zervakis, G. I., 2014, В : Standards in Genomic Sciences. 9, 3, стр. 783-93 11 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

5 Цитирования (Scopus)
2017

Draft genome sequence of Dethiobacter alkaliphilus strain AHT1T, a gram-positive sulfidogenic polyextremophile

Melton, E. D., Sorokin, D. Y., Overmars, L., Lapidus, A. L., Pillay, M., Ivanova, N., del Rio, T. G., Kyrpides, N. C., Woyke, T. & Muyzer, G., 21 сен 2017, В : Standards in Genomic Sciences. 12, 1, 57.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Открытый доступ
6 Цитирования (Scopus)
2015

Correction: The Genomes of the Fungal Plant Pathogens Cladosporium fulvum and Dothistroma septosporum Reveal Adaptation to Different Hosts and Lifestyles But Also Signatures of Common Ancestry [PLoS Genet, 11(12), (2015)]

de Wit, P. J. G. M., van der Burgt, A., Ökmen, B., Stergiopoulos, I., Abd-Elsalam, K. A., Aerts, A. L., Bahkali, A. H., Beenen, H. G., Chettri, P., Cox, M. P., Datema, E., de Vries, R. P., Dhillon, B., Ganley, A. R., Griffiths, S. A., Guo, Y., Hamelin, R. C., Henrissat, B., Shahjahan Kabir, M., Karimi Jashni, M. и 19 др., Kema, G., Klaubauf, S., Lapidus, A., Levasseur, A., Lindquist, E., Mehrabi, R., Ohm, R. A., Owen, T. J., Salamov, A., Schwelm, A., Schijlen, E., Sun, H., van den Burg, H. A., van Ham, R. C. H. J., Zhang, S., Goodwin, S. B., Grigoriev, I. V., Collemare, J. & Bradshaw, R. E., 22 дек 2015, В : PLoS Genetics. 11, 12, e1005775.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхкомментарий, выступление

1 Цитирования (Scopus)
2012

Complete genome sequence of the sulfate-reducing firmicute Desulfotomaculum ruminis type strain (DLT)

Spring, S., Visser, M., Lu, M., Copeland, A., Lapidus, A., Lucas, S., Cheng, J. F., Han, C., Tapia, R., Goodwin, L. A., Pitluck, S., Ivanova, N., Land, M., Hauser, L., Larimer, F., Rohde, M., Göker, M., Detter, J. C., Kyrpides, N. C., Woyke, T. и 9 др., Schaap, P. J., Plugge, C. M., Muyzer, G., Kuever, J., Pereira, I. A. C., Parshina, S. N., Bernier-Latmani, R., Stams, A. J. M. & Klenk, H. P., 1 дек 2012, В : Standards in Genomic Sciences. 7, 2, стр. 304-319 16 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

13 Цитирования (Scopus)
2011

Complete genome sequence of Nitratifractor salsuginis type strain (E9I37-1 T)

Anderson, I., Sikorski, J., Zeytun, A., Nolan, M., Lapidus, A., Lucas, S., Hammon, N., Deshpande, S., Cheng, J. F., Tapia, R., Han, C., Goodwin, L., Pitluck, S., Liolios, K., Pagani, I., Huntemann, M., Mavromatis, K., Ovchinikova, G., Pati, A., Chen, A. и 16 др., Palaniappan, K., Land, M., Hauser, L., Brambilla, E. M., Ngatchou-Djao, O. D., Rohde, M., Tindall, B. J., Göker, M., Detter, J. C., Woyke, T., Bristow, J., Eisen, J. A., Markowitz, V., Hugenholtz, P., Klenk, H. P. & Kyrpides, N. C., 5 окт 2011, В : Standards in Genomic Sciences. 4, 3, стр. 322-330 9 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

8 Цитирования (Scopus)
2012

Genome sequence of the soil bacterium Saccharomonospora azurea type strain (NA-128T)

Klenk, H. P., Held, B., Lucas, S., Lapidus, A., Copeland, A., Hammon, N., Pitluck, S., Goodwin, L. A., Han, C., Tapia, R., Brambilla, E. M., Pötter, G., Land, M., Ivanova, N., Rohde, M., Göker, M., Detter, J. C., Kyrpides, N. C. & Woyke, T., 12 июл 2012, В : Standards in Genomic Sciences. 6, 2, стр. 220-229 10 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

5 Цитирования (Scopus)
2011

Complete genome sequence of Hirschia baltica type strain (IFAM 1418 T)

Chertkov, O., Brown, P. J., Kysela, D. T., de Pedro, M. A., Lucas, S., Copeland, A., Lapidus, A., del Rio, T. G., Tice, H., Bruce, D., Goodwin, L., Pitluck, S., Detter, J. C., Han, C., Larimer, F., Chang, Y. J., Jeffries, C. D., Land, M., Hauser, L., Kyrpides, N. C. и 5 др., Ovchinnikova, G., Tindall, B. J., Göker, M., Klenk, H. P. & Brun, Y. V., 1 дек 2011, В : Standards in Genomic Sciences. 5, 3, стр. 287-297 11 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

6 Цитирования (Scopus)
2012

Genome sequence of the moderately thermophilic, amino-acid-degrading and sulfur-reducing bacterium Thermovirga lienii type strain (Cas60314T)

Göker, M., Saunders, E., Lapidus, A., Nolan, M., Lucas, S., Hammon, N., Deshpande, S., Cheng, J. F., Han, C., Tapia, R., Goodwin, L. A., Pitluck, S., Liolios, K., Mavromatis, K., Pagani, I., Ivanova, N., Mikhailova, N., Pati, A., Chen, A., Palaniappan, K. и 14 др., Land, M., Chang, Y. J., Jeffries, C. D., Brambilla, E. M., Rohde, M., Spring, S., Detter, J. C., Woyke, T., Bristow, J., Eisen, J. A., Markowitz, V., Hugenholtz, P., Kyrpides, N. C. & Klenk, H. P., 12 июл 2012, В : Standards in Genomic Sciences. 6, 2, стр. 230-239 10 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

16 Цитирования (Scopus)
2011

Complete genome sequence of Syntrophobotulus glycolicus type strain (FlGlyR T)

Han, C., Mwirichia, R., Chertkov, O., Held, B., Lapidus, A., Nolan, M., Lucas, S., Hammon, N., Deshpande, S., Cheng, J. F., Tapia, R., Goodwin, L., Pitluck, S., Huntemann, M., Liolios, K., Pagani, I., Mavromatis, K., Ovchinikova, G., Pati, A., Chen, A. и 16 др., Palaniappan, K., Land, M., Hauser, L., Brambilla, E. M., Rohde, M., Spring, S., Sikorski, J., Göker, M., Woyke, T., Bristow, J., Eisen, J. A., Markowitz, V., Hugenholtz, P., Kyrpides, N. C., Klenk, H. P. & Detter, J. C., 5 окт 2011, В : Standards in Genomic Sciences. 4, 3, стр. 371-380 10 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

6 Цитирования (Scopus)

Complete genome sequence of "Thioalkalivibrio sulfidophilus" HL-EbGr7

Muyzer, G., Sorokin, D. Y., Mavromatis, K., Lapidus, A., Clum, A., Pati, A., D'Haeseleer, P., Woyke, T. & Kyrpides, N. C., 5 окт 2011, В : Standards in Genomic Sciences. 4, 1, стр. 23-35 13 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

38 Цитирования (Scopus)

Complete genome sequence of Tolumonas auensis type strain (TA 4T)

Chertkov, O., Copeland, A., Lucas, S., Lapidus, A., Berry, K. W., Detter, J. C., del Rio, T. G., Hammon, N., Dalin, E., Tice, H., Pitluck, S., Richardson, P., Bruce, D., Goodwin, L., Han, C., Tapia, R., Saunders, E., Schmutz, J., Brettin, T., Larimer, F. и 9 др., Land, M., Hauser, L., Spring, S., Rohde, M., Kyrpides, N. C., Göker, M., Beller, H. R., Klenk, H. P. & Woyke, T., 31 окт 2011, В : Standards in Genomic Sciences. 5, 1, стр. 112-120 9 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

2 Цитирования (Scopus)

Complete genome sequence of the cellulolytic thermophile Clostridium thermocellum DSM1313

Feinberg, L., Foden, J., Barrett, T., Davenport, K. W., Bruce, D., Detter, C., Tapia, R., Han, C., Lapidus, A., Lucas, S., Cheng, J. F., Pitluck, S., Woyke, T., Ivanova, N., Mikhailova, N., Land, M., Hauser, L., Argyros, D. A., Goodwin, L., Hogsett, D. и 1 др., Caiazza, N., 1 июн 2011, В : Journal of Bacteriology. 193, 11, стр. 2906-2907 2 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхкомментарий, выступление

55 Цитирования (Scopus)
2014

ExSPAnder: a universal repeat resolver for DNA fragment assembly

Prjibelski, A. D., Vasilinetc, I., Bankevich, A., Gurevich, A., Krivosheeva, T., Nurk, S., Pham, S., Korobeynikov, A., Lapidus, A. & Pevzner, P. A., 2014, В : Bioinformatics. 30, 12, стр. I293-I301

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

53 Цитирования (Scopus)
2016

Permanent draft genome sequence of Desulfurococcus mobilis type strain DSM 2161, a thermoacidophilic sulfur-reducing crenarchaeon isolated from acidic hot springs of Hveravellir, Iceland

Susanti, D., Johnson, E. F., Lapidus, A., Han, J., Reddy, T. B. K., Pilay, M., Ivanova, N. N., Markowitz, V. M., Woyke, T., Kyrpides, N. C. & Mukhopadhyay, B., 2016, В : Standards in Genomic Sciences. 11, 3, 3.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Открытый доступ
1 Цитирования (Scopus)
2017

Permanent draft genome sequence of Desulfurococcus amylolyticus strain Z-533T, a peptide and starch degrader isolated from thermal springs in the Kamchatka Peninsula and Kunashir Island, Russia

Susanti, D., Johnson, E. F., Lapidus, A., Han, J., Reddy, T. B. K., Mukherjee, S., Pillay, M., Perevalova, A. A., Ivanova, N. N., Woyke, T., Kyrpides, N. C. & Mukhopadhyay, B., 1 апр 2017, В : Genome Announcements. 5, 15, e0007817.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Открытый доступ
2 Цитирования (Scopus)
2015

High quality draft genome sequence of Bacteroides barnesiae type strain BL2<sup>T</sup>(DSM 18169<sup>T</sup>) from chicken caecum

Sakamoto, M., Lapidus, A. L., Han, J., Trong, S., Haynes, M., Reddy, T. B. K., Mikhailova, N., Huntemann, M., Pati, A., Ivanova, N. N., Pukall, R., Markowitz, V. M., Woyke, T., Klenk, H-P., Kyrpides, N. C. & Ohkuma, M., 2015, В : Standards in Genomic Sciences. AUGUST2015, 6 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

High-quality permanent draft genome sequence of the extremely osmotolerant diphenol degrading bacterium Halotalea alkalilenta AW-7<sup>T</sup>, and emended description of the genus Halotalea

Ntougias, S., Lapidus, A., Copeland, A., Reddy, T. B. K., Pati, A., Ivanova, N. N., Markowitz, V. M., Klenk, H-P., Woyke, T., Fasseas, C., Kyrpides, N. C. & Zervakis, G. I., 2015, В : Standards in Genomic Sciences. AUGUST2015, 8 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Genome Sequence Databases: Sequencing and Assembly, Reference Module in Biomedical Sciences.

Lapidus, A. L., 2015, Издательский Центр «Академия».

Результат исследований: Книги, отчёты, сборникиэнциклопедия, словарь, справочникнаучнаярецензирование

2012

The Fast Changing Landscape of Sequencing Technologies and Their Impact on Microbial Genome Assemblies and Annotation

Mavromatis, K., Land, ML., Brettin, TS., Quest, DJ., Copeland, A., Clum, A., Goodwin, L., Woyke, T., Lapidus, A., Klenk, HP., Cottingham, RW. & Kyrpides, NC., 2012, В : PLoS ONE. 7, 12, стр. e48837

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

111 Цитирования (Scopus)
2013

Complete genome sequence of the moderate thermophile Anaerobaculum mobile type strain (NGAT)

Mavromatis, K., Stackebrandt, E., Held, B., Lapidus, A., Nolan, M., Lucas, S., Hammon, N., Deshpande, S., Cheng, JF., Tapia, R., Goodwin, LA., Pitluck, S., Liolios, K., Pagani, I., Ivanova, N., Mikhailova, N., Huntemann, M., Pati, A., Chen, A., Palaniappan, K. и 12 др., Land, M., Rohde, M., Spring, S., Göker, M., Woyke, T., Detter, JC., Bristow, J., Eisen, JA., Markowitz, V., Hugenholtz, P., Klenk, HP. & Kyrpides, NC., 2013, В : Standards in Genomic Sciences. 8, 1, стр. 47-57

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

7 Цитирования (Scopus)
2016

Transposable Elements versus the Fungal Genome: Impact on Whole-Genome Architecture and Transcriptional Profiles

Castanera, R. L., López-Varas, L., Borgognone, A., Labutti, K., Lapidus, A., Schmutz, J., Grimwood, J., Pérez, G. M., Pisabarro, A. G., Grigoriev, I. V., Stajich, J. E. & Ram rez, L. A., 1 июн 2016, В : PLoS Genetics. 12, 6, e1006108.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

58 Цитирования (Scopus)
2011

Complete genome sequence and updated annotation of Desulfovibrio alaskensis G20

Hauser, L. J., Land, M. L., Brown, S. D., Larimer, F., Keller, K. L., Rapp-Giles, B. J., Price, M. N., Lin, M., Bruce, D. C., Detter, J. C., Tapia, R., Han, C. S., Goodwin, L. A., Cheng, J. F., Pitluck, S., Copeland, A., Lucas, S., Nolan, M., Lapidus, A. L., Palumbo, A. V. и 1 др., Wall, J. D., 1 авг 2011, В : Journal of Bacteriology. 193, 16, стр. 4268-4269 2 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхкомментарий, выступление

37 Цитирования (Scopus)
2016

High quality permanent draft genome sequence of Phaseolibacter flectens ATCC 12775(T), a plant pathogen of French bean pods

Aizenberg-Gershtein, Y., Izhaki, I., Lapidus, A., Copeland, A., Reddy, T. B. K., Huntemann, M., Pillay, M., Markowitz, V., Goeker, M., Woyke, T., Klenk, H-P., Kyrpides, N. C. & Halpern, M., 2016, В : Standards in Genomic Sciences. 11, 7 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

2014

Genomic encyclopedia of bacteria and archaea: sequencing a myriad of type strains

Kyrpides, N. C., Hugenholtz, P., Eisen, J. A., Woyke, T., Göker, M., Parker, C. T., Amann, R., Beck, B. J., Chain, P. S. G., Chun, J., Colwell, R. R., Danchin, A., Dawyndt, P., Dedeurwaerdere, T., DeLong, E. F., Detter, J. C., De Vos, P., Donohue, T. J., Dong, X-Z., Ehrlich, D. S. и 44 др., Fraser, C., Gibbs, R., Gilbert, J., Gilna, P., Glöckner, F. O., Jansson, J. K., Keasling, J. D., Knight, R., Labeda, D., Lapidus, A., Lee, J-S., Li, W-J., Ma, J., Markowitz, V., Moore, E. R. B., Morrison, M., Meyer, F., Nelson, K. E., Ohkuma, M., Ouzounis, C. A., Pace, N., Parkhill, J., Qin, N., Rossello-Mora, R., Sikorski, J., Smith, D., Sogin, M., Stevens, R., Stingl, U., Suzuki, K-I., Taylor, D., Tiedje, J. M., Tindall, B., Wagner, M., Weinstock, G., Weissenbach, J., White, O., Wang, J., Zhang, L., Zhou, Y-G., Field, D., Whitman, W. B., Garrity, G. M. & Klenk, H-P., 2014, В : PLoS Biology. 12, 8, стр. 1-7

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

121 Цитирования (Scopus)
2013

Genome sequence of Phaeobacter daeponensis type strain (DSM 23529T), a facultatively anaerobic bacterium isolated from marine sediment, and emendation of Phaeobacter daeponensis

Dogs, M., Teshima, H., Petersen, J., Fiebig, A., Chertkov, O., Dalingault, H., Chen, A., Pati, A., Goodwin, L. A., Chain, P., Detter, J. C., Ivanova, N., Lapidus, A., Rohde, M., Gronow, S., Kyrpides, N. C., Woyke, T., Simon, M., Göker, M., Klenk, H. P. и 1 др., Brinkhoff, T., 11 ноя 2013, В : Standards in Genomic Sciences. 9, 1, стр. 142-159 18 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

11 Цитирования (Scopus)
2011

Complete genome sequence of the aerobic marine methanotroph Methylomonas methanica MC09

Boden, R., Cunliffe, M., Scanlan, J., Moussard, H., Kits, K. D., Klotz, M. G., Jetten, M. S. M., Vuilleumier, S., Han, J., Peters, L., Teshima, H., Tapia, R., Kyrpides, N., Pagani, I., Cheng, J. F., Goodwin, L., Han, C., Hauser, L., Land, M. L., Lapidus, A. и 5 др., Lucas, S., Pitluck, S., Woyke, T., Stein, L. & Murrell, J. C., 1 дек 2011, В : Journal of Bacteriology. 193, 24, стр. 7001-7002 2 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхкомментарий, выступление

Открытый доступ
43 Цитирования (Scopus)
2012

CD45-deficient severe combined immunodeficiency caused by uniparental disomy

Roberts, JL., Buckley, RH., Luo, B., Pei, J., Lapidus, A., Peri, S., Wei, Q., Shin, J., Parrott, RE., Dunbrack, RL. J., Testa, JR., Zhong, XP. & Wiest, DL., 2012, В : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 109, 26, стр. 10456-10461

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

25 Цитирования (Scopus)

Erratum: Comparative genomics of Ceriporiopsis subvermispora and Phanerochaete chrysosporium provide insight into selective ligninolysis (Proceedings of the National Academy of Sciences (2012) 109 (5458-5463) DOI: 10.1073/pnas. 1119912109)

Fernandez-Fueyo, E., Ruiz-Dueñas, F. J., Ferreira, P., Floudas, D., Hibbett, D. S., Canessa, P., Larrondo, L. F., James, T. Y., Seelenfreund, D., Lobos, S., Polanco, R., Tello, M., Honda, Y., Watanabe, T., Watanabe, T., Ryu, J. S., Kubicek, C. P., Schmoll, M., Gaskell, J., Hammel, K. E. и 46 др., St John, F. J., Vanden Wymelenberg, A., Sabat, G., BonDurant, S. S., Syed, K., Yadav, J. S., Doddapaneni, H., Subramanian, V., Lavín, J. L., Oguiza, J. A., Perez, G., Pisabarro, A. G., Ramirez, L., Santoyo, F., Master, E., Coutinho, P. M., Henrissat, B., Lombard, V., Magnuson, J. K., Kües, U., Hori, C., Igarashi, K., Samejima, M., Held, B. W., Barry, K. W., LaButti, K. M., Lapidus, A., Lindquist, E. A., Lucas, S. M., Riley, R., Salamov, A. A., Hoffmeister, D., Schwenk, D., Hadar, Y., Yarden, O., De Vries, R. P., Wiebenga, A., Stenlid, J., Eastwood, D., Grigoriev, I. V., Berka, R. M., Blanchette, R. A., Kersten, P., Martinez, A. T., Vicuna, R. & Cullen, D., 22 мая 2012, В : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 109, 21, 1 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхкомментарий, выступление

9 Цитирования (Scopus)
2014

Characterization of Cyanobacterial Hydrocarbon Composition and Distribution of Biosynthetic Pathways

Coates, R. C., Podell, S., Korobeynikov, A., Lapidus, A., Pevzner, P., Sherman, D. H., Allen, E. E., Gerwick, L. & Gerwick, W. H., 2014, В : PLoS ONE. 9, 1, стр. e85140

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

81 Цитирования (Scopus)
2013

Assembling Single-Cell Genomes and Mini-Metagenomes From Chimeric MDA Products

Nurk, S., Bankevich, A., Antipov, D., Gurevich, A. A., Korobeynikov, A., Lapidus, A., Prjibelski, A. D., Pyshkin, A., Sirotkin, A., Sirotkin, Y., Stepanauskas, R., Clingenpeel, S. R., Woyke, T., McLean, J. S., Lasken, R., Tesler, G., Alekseyev, M. A. & Pevzner, P. A., 2013, В : Journal of Computational Biology. 20, 10, стр. 714-737

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

460 Цитирования (Scopus)
2020

MGnify: the microbiome analysis resource in 2020

Mitchell, A. L., Almeida, A., Beracochea, M., Boland, M., Burgin, J., Cochrane, G., Crusoe, M. R., Kale, V., Potter, S. C., Richardson, L. J., Sakharova, E., Scheremetjew, M., Korobeynikov, A., Shlemov, A., Kunyavskaya, O., Lapidus, A. & Finn, R. D., 8 янв 2020, В : Nucleic Acids Research. 48, D1, стр. D570-D578 9 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Открытый доступ
2014

Genome analyses of the carboxydotrophic sulfate-reducers Desulfotomaculum nigrificans and Desulfotomaculum carboxydivorans and reclassification of Desulfotomaculum caboxydivorans as a later synonym of Desulfotomaculum nigrificans

Visser, M., Parshina, SN., Alves, JI., Sousa, DZ., Pereira, IA., Muyzer, G., Kuever, J., Lebedinsky, AV., Koehorst, JJ., Worm, P., Plugge, CM., Schaap, PJ., Goodwin, LA., Lapidus, A., Kyrpides, NC., Detter, JC., Woyke, T., Chain, P., Davenport, KW., Spring, S. и 3 др., Rohde, M., Klenk, HP. & Stams, AJ., 2014, В : Standards in Genomic Sciences. 9, 3, стр. 655-675

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

11 Цитирования (Scopus)
2015

Sequencing, biochemical characterization, crystal structure and molecular dynamics of cellobiohydrolase Cel7A from Geotrichum candidum 3C

Borisova, A. S., Eneyskaya, E. V., Bobrov, K. S., Jana, S., Logachev, A., Polev, D. E., Lapidus, A. L., Ibatullin, F. M., Saleem, U., Sandgren, M., Payne, C. M., Kulminskaya, A. A. & St hlberg, J., 2015, В : FEBS Journal. 282, 23, стр. 4515–4537

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

16 Цитирования (Scopus)
2012

Complete genome sequence of the orange-red pigmented, radioresistant Deinococcus proteolyticus type strain (MRPT)

Copeland, A., Zeytun, A., Yassawong, M., Nolan, M., Lucas, S., Hammon, N., Deshpande, S., Cheng, J. F., Han, C., Tapia, R., Goodwin, L. A., Pitluck, S., Mavromatis, K., Liolios, K., Pagani, I., Ivanova, N., Mikhailova, N., Pati, A., Chen, A., Palaniappan, K. и 17 др., Land, M., Hauser, L., Jeffries, C. D., Brambilla, E. M., Rohde, M., Sikorski, J., Pukall, R., Göker, M., Detter, J. C., Woyke, T., Bristow, J., Eisen, J. A., Markowitz, V., Hugenholtz, P., Kyrpides, N. C., Klenk, H. P. & Lapidus, A., 12 июл 2012, В : Standards in Genomic Sciences. 6, 2, стр. 240-250 11 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

7 Цитирования (Scopus)