3’:5’-AMP-индуцированный конформационный переход регуляторной субъединицы протеинкиназы А Ia запускается ключевыми остатками A202 И A326; Ч I.

О.Н. Рогачева, Б.Ф. Щеголев, В.Е. Стефанов, Г.А. Захаров, E.B. Савватеева-Попова

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Аннотация

Методами молекулярной динамики и лиганд_рецепторного докинга показано, что ключевым событием, инициируемым 3':5'_AMP при связывании c А_ и В_доменами протеинкиназы А Iα, является образование водородной связи между 3':5'_AMP и A202(A326). Движение амидной группы A202(A326) приводит к переходу короткой 310_спирали фосфатсвязывающей кассеты в более длинную α_спираль. Результатом этого процесса является поворот B_спирали. Вторым условием смещения остатка L203(L327) и «упаковки» его в гидрофобный карман является определенная пространственная ориентация β2β3_петли. В результате затруднен переход в В_конформацию А_ и В_доменов протеинкиназы А Iα, несущих точечные мутации R209K и R333K соответственно. 3':5'_AMP_Связывающий домен в отсутствие 3':5'_AMP тоже переходит в B_конформацию. В данном случае движущей силой смещения амидной группы A202(A326), вероятно, является реорганизация спирали фосфатсвязывающей кассеты в более выгодную α_конформацию.
Язык оригиналане определен
Страницы (с-по)568-577
ЖурналБИОХИМИЯ
Том77
Номер выпуска5
СостояниеОпубликовано - 2012

Цитировать