Браузер для генома

Сергей Александрович Симонов, Алексей Игоревич Макунин, Стефан Джеймс О'Брайен

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхОбзор литературы

Аннотация

В статье кратко описываются задачи, которые возможно решать с помощью компьютерного инструмента – геномного браузера как средства для визуализации последовательностей нуклеотидов в геномах и расположения в них геномных элементов. Приводится краткий обзор имеющихся подходов и проводится аналогия с браузерами в Интернете, открывшими новую эру в его развитии. На примере распространенного геномного браузера – GBrowse – описывается как подготовить и увидеть элементы в геноме, как самостоятельно провести компьютерные эксперименты. In the article describe opportunities give to researchers by a computer tools called Genome browsers. The tools implement visualization of genome sequences and genetic elements inside genome. An observe of approaches for a set of genome browsers includes. A open source tool – Gbrowse is describe as an example. Detail description of an opportunities and short instruction to use includes as well as a link to web page for support the article.
Язык оригиналарусский
Страницы (с-по)53-62
ЖурналКОМПЬЮТЕРНЫЕ ИНСТРУМЕНТЫ В ОБРАЗОВАНИИ
Номер выпуска4
СостояниеОпубликовано - 2013

Ключевые слова

  • Геномный браузер
  • биоинформатика
  • визуализация
  • геном
  • генетические элементы
  • браузер
  • genome
  • genome elements
  • visualization
  • genome browser

Цитировать