IV Международная конференция "Bioinformatics: from Algorithms to Applications" ("Биоинформатика: от алгоритмов к применению")

Проект: исполнение гранта/договораисполнение гранта/договора в целом

Сведения о проекте

описание

Ежегодная конференция “Bioinformatics: from Algorithms to Applications”("Биоинформатика: от алгоритмов к применению") по-прежнему является единственным ежегодным международным биоинформатическим мероприятием в Санкт-Петербурге и одним из немногих в стране.
Организатором конференции BiATA 2020 выступает лаборатория «Центр алгоритмической биотехнологии» СПбГУ, всемирную известность которой создал программный продукт SPAdes, позволяющий восстанавливать полную первичную структуру геномной ДНК, на базе которого создано целое семейство программ для работы с геномными, метагеномными, транскриптомными и другими данными (Nurk S, Bankevich A, Antipov D, Gurevich AA, Korobeynikov A, LapidusA, et.al. (2013), Assembling single-cell genomes and mini-metagenomes fromchimeric MDA products. J Comput Biol. Oct;20(10):714-37. doi:10.1089/cmb.2013.0084).
 

За свой недолгий срок мероприятие вызвало большой интерес и получило высокое признание участников. Уровень основных докладчиков говорит сам за себя: Филипп Хугенхольц, Австралийский центр экогеномики, Университет Квинсленда (h-index 98); Терри Гаастерланд, университет Калифорнии в Сан-Диего (h-index 54); РобертФултон, Медицинский факультет Вашингтонского университета (индекс h 50); Донна Музный, Бэйлорский медицинский колледж, Центр секвенирования генома человека(h-index 50); Михаил Гельфанд заместитель директора Института проблем передачи информации (h-index 65), Рейчел Даттон, университет Калифорнии в Сан-Диего, центр метагеномики (h-index 20) и др.

Для достойного приема ученых такого уровня (оплаты билетов, гостиниц, трансферов) мы запрашиваем финансирование в размере 1000000 рублей.

Актуальность проведения конференции обусловлена необходимостью выявления насущных требований сельскохозяйственных,биолого-почвенных и медико-биологических исследований к биоинформатической поддержке.
Такое обсуждение является совершенно уникальным,т.к. чаще всего разработчики и пользователи программ посещают разные конференции и последние не имеют возможности обсудить свои аналитические потребности с создателями программного обеспечения, а разработчики программ лучше понять суть и значение биологических задач.
Ожидается, что в работе конференции примет участие не менее 100 участников – научных сотрудников, аспирантов, студентов,представителей ИТ и фарм компаний. Она проводится уже в четвертый раз, и на предыдущих конференциях с докладами выступали ученые первой величины: Евгений Кунин, Роб Найт, Джиллиан Банфилд, Михаил Гельфанд и т.д.
Методы биоинформатики применяются для решения широкого круга задач от фундаментальной науки до клинической и сельскохозяйственной практики и индустрии: 

- изучение эволюционных процессов: происхождение видов, появление и распространение устойчивости к антибиотикам, и т.д.;
- поиск биологически-активных молекул; 
- высокоэффективная функциональная аннотация геномов, траскриптомов, протеомов, метаболомов микроорганизмов, растений,животных и человека;
- изучение геномов сельскохозяйственных растений и животных и биотехнологически- ценных микроорганизмов; 
- расшифровка геномов важнейших сельскохозяйственных растений и животных; 
- разработка эффективных методов селекции игенетической инженерии на базе геномных и постгеномных технологий; 
- разработка методов создания и применения генетически модифицированных организмов; 
диагностика и изучение молекулярных механизмов генетических заболеваний человека и животных;
- применение методов метагеномики для решениязадач экологии, биотехнологии и медицины;
персонализированный подбор терапии пациентов с различными заболеваниями;
и многое другое.

    Также планируется представить результаты исследований, направленных на анализ генетического потенциала почвенных и водных микробиологических сообществ, их роль в задачах сохранения плодородия и рекультивации почв. Фундаментальные научные исследования в этом случае составляют основу развития прикладных разработок, предназначенных для внедрения в агропромышленное производство.
    По общему мнению участников прошлых лет, BiATA замечательна тем, что представляя на одной площадке знания в области сельского хозяйства, компьютерных технологий, биоинформатики и др.,способствует сотрудничеству между людьми, работающими в разных областях науки,и помогает участникам получить представление о глобальной картине современного переплетения наук. Таких конференций очень немного и их остро не хватает.
    Способствуя более тесному взаимодействию между разными направлениями науки, помогая осознать переход медицины, сельского хозяйства и др. к наукам с большими объёмами данных, все больше нуждающихся в результатах исследований таких областей как микробиология,статистика, биоинформатика и др., и делая это в международном контексте,приглашая докладчиков со всего света, конференция “Bioinformatics: fromAlgorithms to Applications” ("Биоинформатика: от алгоритмов к применению") имеет громадный потенциал и содействует прогрессу в этой области. 
Конференция пройдет 6-8 июля 2020 года в Санкт-Петербурге.

В составе конференции BiATA 2020 продолжат работу секции:

1. Алгоритмы сборки метагеномных данных
2. Большие данные метагеномики
3. Новые алгоритмы сборки и анализа длинных прочтений новых сиквенсных технологий
4. Компьютерная биология и сельское хозяйство:анализ микробиоты почв и воздуха
5. Микробиота человека: питание и здоровье
6. Сравнительная геномика млекопитающих
7. Биоинформатика вирома

Также в рамках конференции пройдет постерная секция.

Инициаторами и организаторами конференции являются профессор кафедры цитологии и гистологии А.Л.Лапидус (председатель организационного и программного комитетов) и доцент кафедры статистического моделирования А.И. Коробейников (заместитель председателя организационного и программного комитетов), обладающие большим опытом организации международных конференций. Так профессор А.Л.Лапидус является со-основателем и членом программного комитета международной конференция SFAF (“Sequencing, Finishing and Analysis in the Future”), проводимой в г. Санта-Фе, Нью-Мексико, США на протяжении 14 лет,членом программных комитетов других международных конференций по биоинформатикеи геномике. А.И.Коробейников имеет опыт организации и проведения международных конференций BiATA2017, BiATA2018 и BiATA2019. 

Рабочий язык конференции английский.


Короткий заголовокBiATA-2020
АкронимNM-2020
СтатусНе запущено
Действительная дата начала/окончания6/07/209/07/20

Ключевые слова

  • биоинформатика
  • алгоритмы
  • большие данные
  • геномика
  • сборка генома
  • транскриптомика
  • протеомика
  • микробиота
  • агро-биологические исследования
  • медико-биологические исследования