1. наименование Конференции, место и сроки ее проведения, организаторы
конференции:
«Chinese Biophysics Congress 2024» проводится с 25 по 28 июля 2024 года в Ланьчжоу, провинция Ганьсу, Китай. Данная конференция проводится Китайским биофизическим сообществом и является крупнейшей биофизической конференцией в Китае. Профессор Тао Сюй, председатель Китайского общества биофизиков, будет председателем организационного комитета.
2.сайт Конференции:
https://www.bsc.org.cn/2024/
3.предполагаемая тема доклада:
Using NMR spectroscopy and MD modeling for structural and dynamic characterization of flexible H4 tails in nucleosome core particle
4. статус доклада:
приглашенный доклад
5. программа Конференции (ссылка на сайт Конференции):
на 03.05.2024 программа конференции не утверждена
https://www.bsc.org.cn/2024/program-1.html
6.состав оргкомитета и программного комитета (ссылка на сайт Конференции):
https://www.bsc.org.cn/2024/introduction.html
7. способ публикации материалов Конференции:
печатные тезисы
8. условия участия в Конференции (ссылка на сайт Конференции):
организационный взнос RMB 2700
https://www.bsc.org.cn/2024/registration.html
9. детальная расшифровка расходов на участие, включенных в смету заявки
см. файл приложенный файл «Смета» в разделе «Документы»
10. указание НИР, реализуемых/реализованных в СПбГУ и связанных с тематикой доклада на Конференции:
Лаборатория биомолекулярного ядерного магнитного резонанса: 2024 г. этап 12, PURE ID: 95443442.
Значение доклада для выполнения НИР:
- ознакомление зарубежных коллег с результатами исследований, проводимых в Лаборатории биомолекулярного ЯМР СПбГУ
- для выполнения условий НИР PURE ID: 95443442 требуется участие в международных конференциях
Печатные тезисы по итогу устного доклада на международной конференции https://flbook.com.cn/c/8SsA7P0El7#page/107
The nucleosome core particle (NCP) is a fundamental unit of genome packaging, wherein 147 base pairs DNA is wrapped ~1.7 times around histone octamer (two copies each of histone proteins H2A, H2B, H3 and H4). Each histone is equipped with flexible tails that extend out from the NCP surface; these tails are essential for chromatin signaling. Here we investigate, both experimentally and via MD modeling, the dynamic behavior and structural propensities of the N-terminal tail of histone H4. First, we assigned the observable HSQC NMR resonances (residues 1-15 of H4) in the reconstituted NCP sample and measured the corresponding 15N relaxation rates. The results suggest that N-terminal portion of the tail, termed N-H41-15, is conformationally flexible, although its motion is slowed down by about 10-fold compared to a free peptide with the same sequence. Next, we turn to paramagnetic relaxation enhancement (PRE) measurements to directly probe the positioning of N-H41-15 tails. For this purpose we have prepared four NCP samples nitroxide spin-labeled at different H3 sites. To interpret the experimental results, we rely on microsecond-long MD simulations of nucleosome particle in explicit water. Remarkably, both PRE rates and 15N relaxation rates measured in N-H41-15 tail are in good agreement with the corresponding MD-based calculated data. Collectively, our results suggest that H4 tail is engaged in “fuzzy interaction” with nucleosomal DNA. This work was in part supported by the SPbU grant AAAA-A16-116102010033-6.
Nucleosome core particle is the fundamental structural unit of chromatin comprised of histone octamer and two turns of DNA wrapped around it. The flexible histone tails carrying multiple posttranslational modifications are instrumental in recruitment of different chromatin associated proteins, including transcription factors. In this report we describe a combination study of histone H4 tails using solution NMR data (heteronuclear relaxation rates and paramagnetic relaxation enhancements) and microsecond-long MD simulations. Our results indicate that H4 tail remains structurally disordered, while at the same time engaged into "fuzzy interaction" with nucleosomal DNA.
| Краткое название | оф-лайн участие, Chinese Biophysics Congress 2024 |
|---|
| Акроним | CONF2024_2 |
|---|
| Статус | Завершено |
|---|
| Эффективные даты начала/конца | 23/07/24 → 1/08/24 |
|---|
| Ссылки | https://flbook.com.cn/c/8SsA7P0El7 |
|---|
