Особое место в ходе выполнения данных работ будет отведено методике извлечения одиночных ядер из клетки и последующим методам single-cell геномики, реализуемых на современной инфраструктурной базе Научного парка СПбГУ. Эти методы позволят нам включить в исследования большое количество видов амеб, которые считается невозможным установить в лабораторных культурах, и для которых выделение единичных клеток возможно лишь из смешанных культур или даже только из природных проб. Наши технические возможности позволяют нам провести полное светомикроскопическое документирование одиночной клетки, а затем при помощи микроманипуляторов извлечь одиночное ядро из этой же клетки для дальнейшего использования в молекулярных исследованиях или использовать эту же клетку для электронной микроскопии. Это метод позволяет радикально решить проблему «ваучеризации» экземпляра амебы при работе с сложно культивируемыми и некультивируемыми организмами.
Основным результатом проекта будет новая система амеб отряда Euamoebida, новые данные о филогении группы и разнообразии ее представителей. Мы планируем наконец решить проблему того, что группа самых «классических», широко известных и используемых в лабораторной практике лобозных амеб остается одной из самых малоизученных. Будет сформулировано новое представление об удельном весе кажущихся «классическими» морфологических признаков эуамебид, предложены молекулярные критерии для выделения родов и семейств в пределах этой группы амеб. Недавние находки, показавшие тесное родство амеб рода Copromyxa с амебами рода Hartmannella, поднимают проблему выявления сложных жизненных циклов у голых лобозных амеб. Эти находки показывают, что независимое становление жизненных циклов в пределах Amoebozoa шло в нескольких эволюционных ветвях параллельно, что ставит под сомнение широко распространенную идею о первичном формировании сложного жизненного цикла Amoebozoa (по типу Mycetozoa) с его последующим упрощением в отдельных филогенетических ветвях. В свете этих проблем корректное понимание путей эволюции амеб отряда Euamoebida имеет фундаментальное значение для понимания путей становления сложных жизненных циклов у амебоидных протистов.