Научная проблема, на решение которой направлен проект
Научная проблема, на решение которой направлен проект, заключается в исследовании эволюционных аспектов современной концепции «Функциональных амилоидов». Согласно этой концепции амилоидные фибриллы, обладающие рядом уникальных физических и биохимических свойств, являются неотъемлемыми и порой незаменимыми компонентами самых разнообразных жизненно важных структур. В частности, мы показали, что белок FXR1, регулирующий стабильность и трансляцию РНК, в норме функционирует в мозге млекопитающих в амилоидной форме. В ходе реализации проекта планируется оценить эволюционный консерватизм амилоидных свойств этого РНК-связывающего белка у позвоночных животных.
Исследования эволюционного консерватизма амилоидных свойств FXR1 тесно связаны с вопросом о функциональной роли амилоидной агрегации этого белка в головном мозге в норме и при патологии. На основании литературных и наших предварительных данных мы предлагаем гипотезу, согласно которой дезинтеграция амилоидных агрегатов FXR1, связывающих мРНК фактора TNF alpha, является важным фактором, регулирующим ответ нейронов головного мозга на стрессовые условия. В рамках проекта будет охарактеризовано влияние болезни Альцгеймера на уровень агрегации РНК-связывающего белка FXR1 в клетках головного мозга. Таким образом, проект направлен на решение проблемы исследования эволюционного консерватизма амилоидов и выяснение функциональной роли этих структур в головном мозге.
Научная значимость и актуальность решения обозначенной проблемы
Научная значимость проекта определяется тем, что его реализация позволит сделать выводы как об эволюционном консерватизме функционального амилоида FXR1 в мозге позвоночных, так и о биологической роли этих фибриллярных структур в регуляции жизненно важных процессов. Это исследование будет способствовать изменению стереотипных представлений о том, что наличие функциональных амилоидных фибрилл в организме эукариот является своеобразным парадоксом. Мы исходим из концепции, согласно которой уникальные физические свойства этих фибриллярных структур позволяют рассматривать их в качестве структурного материала, который широко используется в эволюции различных организмов. Запланированные исследования впервые позволят оценить эволюционный консерватизм амилоидных свойств белка FXR1 в мозге позвоночных животных.
Значимость и актуальность проекта связана также с тем, что он направлен на исследование функций амилоидных агрегатов этого белка в головном мозге. Анализ литературных данных и наши предварительные результаты позволили сформулировать рабочую гипотезу, согласно которой сборка – разборка амилоидных фибрилл FXR1 может регулировать трансляцию ключевого провоспалительного фактора TNF alpha в нейронах головного мозга. Таким образом, изменения уровня агрегации FXR1 могут являться важным компонентом регуляторного каскада, контролирующего ответ клеток головного мозга на неблагоприятные условия. Проверка этой гипотезы актуальна как с фундаментальной, так и с биомедицинской точки зрения. В случае подтверждения рабочей гипотезы полученные в рамках этого небольшого двухгодичного проекта результаты откроют новые перспективы для исследования молекулярного механизма, регулирующего разборку агрегатов FXR1 при воспалении в головном мозге.
Конкретная задача (задачи) в рамках проблемы, на решение которой направлен проект, ее масштаб и комплексность
Целью работы является анализ эволюционного консерватизма и биологической значимости амилоидных свойств белка FXR1 в мозге позвоночных
Для достижения поставленной цели сформулированы следующие задачи:
1.Оценить колокализацию белка FXR1 с амилоидспецифичными красителями тиофлавином S и Конго красным на криосрезах головного мозга представителей различных классов позвоночных животных (костистых рыб, рептилий, земноводных и птиц).
2.Исследовать наличие детергент-устойчивых амилоидоподобных агрегатов белка FXR1 в головном мозге представителей различных классов позвоночных.
3.Выделить с помощью иммунопреципитации белок FXR1 из мозга исследуемых видов позвоночных и оценить его амилоидные свойста ex vivo.
4.Оценить влияние нейродегенерации при болезни Альцгеймера на уровень агрегации РНК-связывающего белка FXR1 в головном мозге человека.
5.Охарактеризовать корреляцию уровня агрегации FXR1 с уровнем продукции фактора TNF alpha на фоне нейродегенерации, вызванной болезнью Альцгеймера.
Масштабность и комплексность поставленных задач определяются тем, что в данном исследовании мы не ограничиваемся анализом свойств конкретного белка у одного модельного организма. Мы впервые ставим задачу оценки эволюционного консерватизма функционального амилоида в мозге позвоночных и используем для решения этой задачи различные объекты (радужная форель, шпорцевая лягушка, красноухая черепаха и домашняя курица). Комплексность проекта также заключается в том, что помимо эволюционного анализа исследование включает сравнительный анализ уровня агрегации FXR1 в головном мозге в норме и при нейродегенерации. Изменение уровня агрегации РНК-связывающего белка FXR1 может являться важным фактором регуляции трансляции TNF alpha, контролирующего воспалительные процессы.
Научная новизна исследований, обоснование того, что проект направлен на развитие новой для научного коллектива тематики******, обоснование достижимости решения поставленной задачи (задач) и возможности получения предполагаемых результатов
******В том числе, на определение объекта и предмета исследования, составление плана исследования, выбор методов исследования.
Анализ эволюционного консерватизма функциональных амилоидов является новой задачей не только для коллектива, но и для научного сообщества. До настоящего времени функциональные амилоиды выявлялись у отдельных модельных объектов и эволюционные аспекты происхождения этих фибриллярных структур не исследовались. Недавно мы показали, что белок FXR1, регулирующий стабильность и трансляцию мРНК, функционирует в амилоидной форме в головном мозге крысы и в клетках нейробластомы человека [Sopova et al., 2019]. В данном проекте будут оцениваться амилоидные свойства этого белка в головном мозге представителей различных классов позвоночных животных. Поставленная задача достижима, поскольку методология запланированных исследований успешно использовалась коллективом в работе по выявлению амилоидных фибрилл этого белка в головном мозге крысы [Sopova et al., 2019].
Вопрос об эволюционном консерватизме амилоидных свойств тесно связан с исследованием функциональной значимости формирования агрегатов FXR1. Это направление исследований также является новым. Наши предварительные данные и результаты других исследователей, полученные в экспериментах с культурами клеток, позволяют высказать обоснованную гипотезу о функциональной роли агрегации FXR1 в головном мозге. Мы полагаем, что как в культуре клеток, так и в нейронах головного мозга при неблагоприятных условиях агрегаты этого белка, связывающие молекулы РНК, расщепляются, и это способствует активации трансляции фактора TNF alpha, контролирующего клеточный ответ. Таким образом, сборка – разборка амилоидных агрегатов FXR1 может являться важным фактором регуляции воспалительного процесса в головном мозге. Для проверки этой гипотезы будет проведён сравнительный анализ агрегации белка FXR1 в коре головного мозга при болезни Альцгеймера и в контрольных образцах из мозга людей, умерших по причинам, не связанным с нейродегенерацией. Возможность получения результатов определяется двумя факторами: во первых, необходимые образцы головного мозга готова предоставить городская больница №40 в соответствии с ранее заключённым договором с Биобанком СПбГУ (образцы имеются в наличии); во вторых, методики, которые будут применяться в работе, успешно использовались коллективом ранее [Sopova et al., 2019].
Современное состояние исследований по данной проблеме, основные направления исследований в мировой науке и научные конкуренты
Амилоиды представляют собой фибриллярные белковые агрегаты, которые формируются за счёт образования упорядоченных межмолекулярных бета-складчатых слоёв (или иначе говоря, кросс-бета структур) [Baxa, 2008]. Белки, способные формировать амилоидные фибриллы, найдены у самых разных организмов. Условно все амилоиды можно разделить на две группы: патологические и функциональные.
Формирование патологических амилоидных фибрилл приводит к развитию тяжёлых и зачастую неизлечимых заболеваний – амилоидозов. Амилоидозы подразделяют на
инфекционные, наследственные и спорадические [Picken, 2020]. К инфекционным амилоидозам относятся прионные заболевания, связанные с передачей от одного организма к другому инфекционных частиц (прионов), представляющих собой амилоидную изоформу белка PrPSc (prion protein scrapie). Проникновение в организм чужеродных частиц PrPSc вызывает амилоидогенез нормальной клеточной изоформы PrPC (prion protein cellular) [Baskakov, Breydo, 2007]. Наследственные формы представлены амилоидозами, связанными с продукцией мутантных белков. К таким формам относятся, в частности, ранняя форма болезни Альцгеймера [Wu et al., 2012], болезнь Хантингтона [Petersén et al., 2001] и амилоидозы, связанные с мутациями в гене, кодирующем белок PrP [Mastrianni, 2010]. Наиболее распространёнными являются спорадические амилоидозы, для которых характерно формирование патологических амилоидных агрегатов белков без изменения их аминокислотной последовательности. Случаи возникновения спорадических амилоидозов составляют 90–95%, тогда как на долю наследственных и инфекционных амилоидозов приходятся оставшиеся 5–10% [Galkin, Sisoev, 2021]. Недавно мы предложили концепцию, согласно которой все спорадические амилоидозы являются вторичными событиями, которые провоцируются различными заболеваниями, вызывающими стрессорный ответ [Galkin, Sisoev, 2021]. Анализ литературных данных показывает, что клеточный стресс-ответ провоцирует сверхпродукцию, увеличение локальной концентрации или модификацию почти всех охарактеризованных на настоящий момент белков, образующих амилоидные фибриллы при спорадических амилоидозах [Galkin, Sisoev, 2021].
К числу наиболее социально значимых амилоидных заболеваний человека относятся болезни Альцгеймера, Паркинсона и Хангтингтона. По данным Всемирной Организации Здравоохранения, болезнь Альцгеймера является самым распространенным в мире неизлечимым нейродегенеративным заболеванием. Только в США от болезни Альцгеймера, связанной с амилоидогенезом пептида Abeta, страдает более 5,3 млн. человек. Согласно прогнозам, в связи с увеличением средней продолжительности жизни, к 2050 году эта цифра увеличится в 3 раза [Alzheimer’s Association, 2015]. Важно отметить, что многие амилоидозы человека и животных являются неизлечимыми и приводят к летальным последствиям. Некоторые лекарственные препараты задерживают развитие болезни, но не могут остановить процесс формирования цитотоксических амилоидных фибрилл. Помимо нейродегенеративных заболеваний охарактеризован целый ряд системных и локальных амилоидозов человека и животных, которые поражают различные органы и ткани.
Функциональные амилоиды обнаружены у бактерий, дрожжей, растений, а также позвоночных животных и человека [Syed and Boles, 2014; Antonets et al., 2020; Sergeeva and Galkin, 2020]. Большинство бактериальных амилоидов является необходимым компонентом экстраклеточной биоплёнки, которая обеспечивает прикрепление клеток к субстрату при определённых условиях внешней среды. В частности, у E. coli охарактеризован амилоидный белок CsgA, фибриллы которого формируют каркас биоплёнки [Chapman et al., 2002]. Помимо этого, некоторые бактерии секретируют амилоидные олигомеры, токсичные для клеток организма-хозяина, клеток грибов или других бактерий. Показано также, что в пигментных клетках человека амилоидные фибриллы фрагмента белка Pmel17 необходимы для полимеризации молекул меланина, что способствует защите клеток от целого ряда цитотоксических воздействий, включая ультрафиолет и оксидативный стресс [Fowler et al., 2006]. Кроме того, некоторые гормоны гипофиза млекопитающих запасаются в секреторных гранулах в обратимой амилоидной форме [Maji et al., 2009]. Белок CPEB молюска Aplysia californica и его ортолог CPEB-3 Mus musculus при прохождении нервного импульса формируют в нейронах детергент-устойчивые олигомеры, что способствует стабилизации нервных синапсов [Si et al. 2010; Fioriti et al., 2015]. Авторы этих работ полагают, что эти олигомеры имеют амилоидную природу, однако связывание с амилоид-специфичными красителями олигомеров CPEB и CPEB-3 в естественных условиях в нейронах не показано. Вместе с тем, установлено, что белок Orb2 Drosophila melanogaster, который является ортологом CPEB, в нейронах головного мозга специфически окрашивается Конго красным [Hervas et al., 2020]. Отметим, что окрашивание Конго красным и двойное лучепреломление в поляризованном свете после такого окрашивания является золотым стандартом идентификации амилоидов in vivo [Benson et al., 2018].
Недавно мы показали, что РНК-связывающий белок FXR1, ответственный за регуляцию памяти и психоэмоционального состояния, функционирует в нейронах головного мозга крысы Rattus norvegicus в амилоидной форме [Sopova et al., 2019; см. также «Имеющийся задел»]. Этот белок формирует в мозге фибриллы, которые специфически окрашиваются Конго красным и демонстрируют жёлто-зелёное свечение в поляризованном свете, что характерно для всех классических амилоидов. Молекулы РНК, связавшиеся в цитоплазме нейронов с амилоидными частицами FXR1, не чувствительны к обработке РНК-азами [Sopova et al., 2019]. Амилоидные фибриллы этого белка, согласно нашим данным, также представлены в культуре клеток нейробластомы человека [Sopova et al., 2019]. Данные о способности FXR1 формировать функциональные амилоидные фибриллы в мозге других позвоночных пока не получены.
FXR1 относится к семейству Fragile X-Related (FXR), которое включает в себя также белки FMRP и FXR2. Эти белки содержат РНК-связывающие мотивы KH1/KH2 и RGG [Brown et al. 2001; Le Tonquese et al. 2016]. FXR1 продуцируется во многих типах клеток и связывает различные молекулы РНК, включая регуляторные микро РНК и РНК фактора некроза опухолей TNF alpha [Brown et al., 2001; Le Tonquese et al., 2016]. Неудивительно, что он регулирует важные физиологические процессы, в частности в головном мозге. Известно, что FXR1 вовлечён в регуляцию долговременной памяти и эмоционального состояния. Мыши, у которых этот белок сверхпродуцируется в головном мозге, значительно лучше запоминают пути прохождения лабиринтов, чем мыши дикого типа [Cook et al., 2014]. Вместе с тем, мыши, у которых продукция FXR1 в головном мозге снижена, в отличие от других мышей, не впадают в депрессию и сохраняют хорошее настроение даже после специальных экспериментальных воздействий [Del’Guidice et al., 2015]. Можно предположить, что они не впадают в депрессию просто потому, что не запоминают стрессирующие воздействия, которым подвергают их экспериментаторы. Обычно FXR1 выступает в роли негативного регулятора трансляции [Mazroui et al., 2002]. Вместе с тем, в экспериментах с культурами клеток было показано, что при неблагоприятных условиях крупные РНП-комплексы, которые содержат молекулы РНК и белок FXR1, разбираются на мелкие частицы, что способствует активации трансляции мРНК. В частности, при отсутствии сыворотки в питательной среде происходит разборка крупных РНП-гранул, и FXR1 активирует трансляцию связанных с ним молекул РНК TNF alpha [Vasudevan, Steitz, 2007]. TNF alpha является фактором, активирующим трансляцию мРНК цитокинов при воспалительных процессах [Tanabe et al., 2010]. В нейронах головного мозга и глиальных клетках уровень трансляции TNF alpha резко повышается при хронических воспалениях, вызванных болезнями Альцгеймера и Паркинсона, а также инсультами [Strohmeyer, Rogers, 2001]. В случае необратимых нейродегенеративных заболеваний сверхэкспрессия TNF alpha не спасает клетки от гибели, а наоборот, ускоряет этот процесс и активирует микроглию [Janelsins et al., 2008]. Мы полагаем, что при нейродегенеративных заболеваниях, также как и в культуре клеток, каскад, запускающий сверхпродукцию TNF alpha, включает разборку крупных амилоидных частиц, содержащих белок FXR1 и молекулы РНК TNF alpha. В ходе реализации представленного проекта мы планируем исследовать данный этап регуляторного каскада, запускающего сверхэкспрессию TNF alpha и цитокинов при необратимой нейродегенерации. Исследования молекулярного механизма, обеспечивающего разборку агрегатов FXR1, может стать в будущем темой отдельного большого и перспективного проекта.
Вопрос о научной конкуренции по теме заявленного проекта стоит рассмотреть с двух сторон. Исследования эволюционного консерватизма функциональных амилоидов могут быть проведены в лаборатории доктора Келли (Department of Chemistry and The Skaggs Institute of Chemical Biology, USA), который показал, что формирование амилоидных фибрилл фрагмента белка PMEL17 необходимо для синтеза и запасания меланина в меланоцитах млекопитающих [Fowler et al., 2006]. Для белков семейства CPEB исследования амилоидных свойств проводились у разных организмов (дрозофила, моллюск, мышь), но чёткие доказательства формирования амилоидных фибрилл получены только для ортолога этого белка у Drosophila melanogaster [Hervas et al., 2020]. Авторы этой работы могли бы применить использованную методологию для проведения сходных экспериментов на других организмах. В исследовании вопроса о дезинтеграции крупных амилоидных частиц белка FXR1 при нейродегенеративных процессах конкуренцию могут составить лаборатории доктора Мюрэй (Centre for Research in Neuroscience, Department of Neurology and Neurosurgery, Montreal, Canada) и доктора Булье (Department of Psychiatry and Neuroscience, Faculty of Medicine, Université Laval, Québec-City, QC, Canada). Эти лаборатории являются мировыми лидерами в исследовании функциональной значимости белка FXR1 в нейронах головного мозга. Также конкуренцию в этом направлении могла бы составить лаборатория проф. Инги Зерр (Department of Neurology, University Medical Center Göttingen and the German Center for Neurodegenerative Diseases), которая является одним из лидеров по выявлению маркёров социально значимых нейродегенеративных заболеваний. Однако мы сотрудничаем с этой лабораторией, что отражает наша совместная публикация [Younas et al., 2020], и мы имеем договорённость, что анализ эффектов агрегации FXR1 является зоной наших интересов.
Список литературы:
1. Alzheimer’s Association. 2015 Alzheimer's disease facts and figures. Alzheimers Dement. – 2015. – Vol. 11, №3. – P. 332–384.
2. Antonets KS, Belousov MV, Sulatskaya AI, Belousova ME, Kosolapova AO, Sulatsky MI, Andreeva EA, Zykin PA, Malovichko YV, Shtark OY, Lykholay AN, Volkov KV, Kuznetsova IM, Turoverov KK, Kochetkova EY, Bobylev AG, Usachev KS, Demidov ON, Tikhonovich IA, Nizhnikov AA. Accumulation of storage proteins in plant seeds is mediated by amyloid formation. PLoS Biol. 2020, 18(7):e3000564. doi: 10.1371/journal.pbio.3000564
3. Baskakov I. V., Breydo L. Converting the prion protein: What makes the protein infectious // Biochim. Biophys. Acta - Mol. Basis Dis. 2007. Vol. 1772. P. 692–703.
4. Baxa U. Structural basis of infectious and non-infectious amyloids. Curr. Alzheimer Res. – 2008. - Vol. 5, №3. – P. 308–318.
5. Benson MD, Buxbaum JN, Eisenberg DS, Merlini G, Saraiva MJM, Sekijima Y, Sipe JD, Westermark P. Amyloid nomenclature 2018: recommendations by the International Society of Amyloidosis (ISA) nomenclature committee. Amyloid. 2018 Dec;25(4):215-219. doi: 10.1080/13506129.2018.1549825
6. Brown, V. et al. Microarray identification of FMRP-associated brain mRNAs and altered mRNA translational profiles in fragile X syndrome. Cell. 107, 477–87 (2001).
7. Chapman M.R. Role of Escherichia coli Curli Operons in Directing Amyloid Fiber Formation Science. – 2002. – Vol. 295, №5556. – P. 851–855.
8. Cook, D. et al. FXR1P limits long-term memory, long-lasting synaptic potentiation, and de novo GluA2 translation. Cell Rep. 9, 1402–1416 (2014).
9. Del’Guidice, T. et al. FXR1P is a GSK3β substrate regulating mood and emotion processing. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 112, E4610–9 (2015)
10. Fioriti L, Myers C, Huang YY, et al. The Persistence of Hippocampal-Based Memory Requires Protein Synthesis Mediated by the Prion-like Protein CPEB3. Neuron. 2015;86(6):1433–1448. doi:10.1016/j.neuron.2015.05.021
11. Fowler D.M., Koulov A.V., Alory–Jost C., Marks M.S., Balch W.E., Kelly J.W. Functional amyloid formation within mammalian tissue. PLoS Biol. – 2006. – Vol. 4, № 1. – e6. doi: 10.1371/journal.pbio.0040006
12. Galkin AP, Sysoev EI. Stress Response Is the Main Trigger of Sporadic Amyloidoses. Int J Mol Sci. 2021 Apr 15;22(8):4092. doi: 10.3390/ijms22084092. PMID: 33920986; PMCID: PMC8071232.
13. Hervas R, Rau MJ, Park Y, Zhang W, Murzin AG, Fitzpatrick JAJ, Scheres SHW, Si K. Cryo-EM structure of a neuronal functional amyloid implicated in memory persistence in Drosophila. Science. 2020 Mar 13;367(6483):1230-1234. doi: 10.1126/science.aba3526.
14. Janelsins MC, Mastrangelo MA, Park KM, Sudol KL, Narrow WC, Oddo S, LaFerla FM, Callahan LM, Federoff HJ, Bowers WJ. Chronic neuron-specific tumor necrosis factor-alpha expression enhances the local inflammatory environment ultimately leading to neuronal death in 3xTg-AD mice. Am J Pathol. 2008 Dec;173(6):1768-82. doi: 10.2353/ajpath.2008.080528.
15. Le Tonquese, O. et al. Regulation of monocyte induced cell migration by the RNA binding protein, FXR1. Cell Cycle. 15, 1874–1882 (2016).
16. Maji SK, Perrin MH, Sawaya MR, et al. Functional amyloids as natural storage of peptide hormones in pituitary secretory granules. Science. 2009;325(5938):328–332. doi:10.1126/science.1173155
17. Mastrianni J.A. The genetics of prion diseases // Genet. Med. 2010. Vol. 12. P. 187–195.
18. Mazroui, R., Huot, M.E., Tremblay, S., Filion, C., Labelle, Y., andKhandjian, E.W. (2002). Trapping of messenger RNA by Fragile X Men-tal Retardation protein into cytoplasmic granules induces translationrepression. Hum. Mol. Genet.11, 3007–3017
19. Petersén Å. et al. Expanded CAG repeats in exon 1 of the Huntington’s disease gene stimulate dopamine-mediated striatal neuron autophagy and degeneration // Hum. Mol. Genet. 2001. Vol. 10. P. 1243–1254
20. Picken M.M. The Pathology of Amyloidosis in Classification: A Review // Acta Haematol. S. Karger AG, 2020. Vol. 143, № 4. P. 322–334.
21. Sergeeva AV, Galkin AP. Functional amyloids of eukaryotes: criteria, classification, and biological significance. Curr Genet. 2020; 66(5):849-866. doi: 10.1007/s00294-020-01079-7
22. Si, K. Choi, Y. B. White-Grindley, E. Majumdar, A. & Kandel, E. R. Aplysia CPEB can form prion-like multimers in sensory neurons that contribute to long-term facilitation. Cell. 140, 421–435 (2010)
23. Sopova JV, Koshel EI, Belashova TA, Zadorsky SP, Sergeeva AV, Siniukova VA, Shenfeld AA, Velizhanina ME, Volkov KV, Nizhnikov AA, Kachkin DV, Gaginskaya ER, Galkin AP. RNA-binding protein FXR1 is presented in rat brain in amyloid form. Sci Rep. 2019; 9(1):18983. doi: 10.1038/s41598-019-55528-6.
24. Strohmeyer R, Rogers J. Molecular and cellular mediators of Alzheimer’s disease inflammation. J Alzheimers Dis. 2001;3:131–157.
25. Syed AK, Boles BR. Fold modulating function: bacterial toxins to functional amyloids. Front Microbiol. 2014 Aug 1;5:401. doi: 10.3389/fmicb.2014.00401.
26. Tanabe, K., Matsushima-Nishiwaki, R., Yamaguchi, S. et al. Mechanisms of tumor necrosis factor-α-induced interleukin-6 synthesis in glioma cells. J Neuroinflammation 7, 16 (2010).
27. Vasudevan, S., Steitz, J. A. AU-rich-element-mediated upregulation of translation by FXR1 and Argonaute 2. Cell. 128, 105–118 (2007).
28. Wu L. et al. Early-onset familial alzheimer’s disease (EOFAD) // Can. J. Neurol. Sci. 2012. Vol. 39. P. 436–445.
29. Younas N, Zafar S, Shafiq M, Noor A, Siegert A, Arora AS, Galkin A, Zafar A, Schmitz M, Stadelmann C, Andreoletti O, Ferrer I, Zerr I. SFPQ and Tau: critical factors contributing to rapid progression of Alzheimer's disease. Acta Neuropathol. 2020 Sep;140(3):317-339. doi: 10.1007/s00401-020-02178-y.
Публикации коллектива за последние пять лет:1. Galkin AP, Sysoev EI. Stress Response Is the Main Trigger of Sporadic Amyloidoses. Int J Mol Sci. 2021 Apr 15;22(8):4092. doi: 10.3390/ijms22084092. PMID: 33920986; PMCID: PMC8071232. IF 5.923
https://www.mdpi.com/1422-0067/22/8/4092
2. Sergeeva AV, Belashova TA, Bondarev SA, Velizhanina ME, Barbitoff YA, Matveenko AG, Valina AA, Simanova AL, Zhouravleva GA, Galkin AP. Direct proof of the amyloid nature of yeast prions [PSI+] and [PIN+] by the method of immunoprecipitation of native fibrils. FEMS Yeast Res. 2021 Sep 11;21(6):foab046. doi: 10.1093/femsyr/foab046. IF 2.796
https://academic.oup.com/femsyr/article-abstract/21/6/foab046/6360323?redirectedFrom=fulltext
3. Younas N, Zafar S, Shafiq M, Noor A, Siegert A, Arora AS, Galkin A, Zafar A, Schmitz M, Stadelmann C, Andreoletti O, Ferrer I, Zerr I. SFPQ and Tau: critical factors contributing to rapid progression of Alzheimer's disease.
Acta Neuropathol. 2020 Sep;140(3):317-339. doi: 10.1007/s00401-020-02178-y. IF 18.174
https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00401-020-02178-y
4. Galkin AP. Hypothesis: AA amyloidosis is a factor causing systemic complications after coronavirus disease. Prion. 2021 Dec;15(1):53-55. doi: 10.1080/19336896.2021.1910468. IF 3.931
https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00401-020-02178-y
5. Sergeeva AV, Galkin AP. Functional amyloids of eukaryotes: criteria, classification, and biological significance. Curr Genet. 2020 Oct;66(5):849-866. doi: 10.1007/s00294-020-01079-7 IF 3.7
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32356034/
6. Sopova JV, Koshel EI, Belashova TA, Zadorsky SP, Sergeeva AV, Siniukova VA, Shenfeld AA, Velizhanina ME, Volkov KV, Nizhnikov AA, Kachkin DV, Gaginskaya ER, Galkin AP. RNA-binding protein FXR1 is presented in rat brain in amyloid form. Sci Rep. 2019 Dec 12;9(1):18983. doi: 10.1038/s41598-019-55528-6 IF 5.133
https://www.nature.com/articles/s41598-019-55528-6
7. Sergeeva AV, Sopova JV, Belashova TA, Siniukova VA, Chirinskaite AV, Galkin AP, Zadorsky SP. Amyloid properties of the yeast cell wall protein Toh1 and its interaction with prion proteins Rnq1 and Sup35. Prion. 2019. 13(1):21-32.
doi: 10.1080/19336896.2018.1558763. IF 3.931
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6422396/
8. Ryzhova T.A, Sopova J.V., Zadorsky S.P., Siniukova V.A., Sergeeva A.V., Nizhnikov A.A., Shenfeld A.A., Volkov K.V and Galkin A.P. Screening for amyloid proteins in the yeast proteome. Curr Genet. 2018. 64(2):469-478. doi: 10.1007/s00294-017-0759-7. . IF 3.7. https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00294-017-0759-7
9. Сопова ЮВ, Задорский СП, Велижанина МЕ, Чиринскайте АВ, Галкин АП, Инге-Вечтомов СГ. Сближение прионных доменов способствует инициации прионизации белка. Генетика, 2018, Т.54, Приложение, C. S10-S13. DOI: 10.1134/S0016675818130180 IF 0.559. http://vigg.ru/genetika/html/annot/2018/18.suppl.html
10. Галкин А.П., Велижанина М.Е., Сопова Ю.В., Шенфельд А.А., Задорский С.П. (2018). Прионы и неинфекционные амилоиды млекопитающих – сходства и отличия. Биохимия, том 83, выпуск 10, С. 1184-1195. DOI.10.1134/S0006297918100048 IF 1.724 (https://link.springer.com/article/10.1134/S0006297918100048) SJR 1.719
11. Galkin A.P. 2017. Prions and concept of polyprionic inheritance. Curr Genet. 2017t;63(5):799-802. doi: 10.1007/s00294-017-0685-8. IF 3.7. https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00294-017-0685-8
