Топологически-ассоциированные домены хроматина и А/В-компартменты в геноме курицы: идентификация и визуализация с помощью технологии HiC и микроскопии сверхвысокого разрешения: 2021 г. этап 3

Проект: исполнение гранта/договораисполнение этапа гранта/договора

Сведения о проекте

описание

Пространственная организация генома в интерфазном ядре играет ключевую роль в регуляции экспрессии генов, благодаря тесной взаимосвязи между иерархическими уровнями упаковки генома и его функциональной активностью. Сочетание современных биохимических и биоинформатических подходов позволили идентифицировать в интерфазном ядре хроматиновые нанодомены, в том числе топологически-ассоциированные домены и А/В компартменты. Реорганизация хроматиновых доменов в ходе дифференцировки клеток, в патологическом состоянии и в ответ на различные внешние воздействия остается мало изученной. Значительные усилия также направлены на сопоставление данных, полученных методами визуализации геномных локусов и технологии захвата конформации хроматина. В рамках этой проблемы представляется целесообразными исследование пространственной организации генома с помощью комплексного подхода, сочетающего современные методы HiC и 3D-FISH, на различных модельных объектах. Кроме того, актуальным является исследование механизмов установления специфической архитектуры генома в специализированных типах клеток. Для решения этой задачи представляется важным исследовать роль различных архитектурных белков хроматина в поддержании пространственной организации генома на уровне отдельных хроматиновых доменов.
АкронимRSF_SR_IF_2019 - 3
СтатусАктивный
Действительная дата начала/окончания11/01/2131/12/21

Ключевые слова

  • геном домашней курицы, интерфазное ядро, архитектура генома, захват конформации хроматина, HiC, топологически-ассоциированные домены, флуоресцентная гибридизация in situ, редактирование генома, когезин, нокдаун гена, крупномасштабная организация хроматина, дифференцировка эритроцитов, 3D-FISH