Командировка для выполнения совместной научной работы в Университете города Сиена, Италия.

Проект: исполнение гранта/договораисполнение гранта/договора в целом

описание

2.5.1. Факультет Биотехнологий, Химии и Фармацевтики Университета г. Сиена, группа профессора Массимо Оливуччи
2.5.2. Профессор Массимо Оливуччи, ORCID 0000-0002-8247-209X, индекс Хирша 62, количество публикаций в Scopus: 235; количество цитирований: 11760
награды
1. National Prize "FEDERCHIMICA", 1999.
2. Finalist of the European Community 2001 Descartes Prize for scientific excellence
3. Research Prize 2004 of the Organic Chemistry Division of the Italian Chemical Society.
4. “Angelo Mangini” (Gold) Medal for Research 2010 of the Organic Chemistry (http://www.iupac.cnr.it/2-non-categorizzato/42-massimo-olivucci)

2.5.3. Разработка оптических сенсоров мембранного потенциала на основе родопсинов с заданными оптическими свойствами.

2.5. 4 Принимающая сторона оплачивает перелет и частично компенсирует суточные
2.5. 5 Файл смета приложен
2.5.6 Дипломная работа Фомина Андрея Дмитриевича, магистратура 1 курс

основные результаты по проекту в целом

Название принимающей организации:
Факультет Биотехнологий, Химии и Фармацевтики Университета г. Сиена, Италия

Сведения об ученом, с которым была проведена совместная научная работа:
Профессор Массимо Оливуччи, ORCID 0000-0002-8247-209X, индекс Хирша 62, количество публикаций в Scopus: 235; количество цитирований: 11760
Награды
1. National Prize "FEDERCHIMICA", 1999.
2. Finalist of the European Community 2001 Descartes Prize for scientific excellence
3. Research Prize 2004 of the Organic Chemistry Division of the Italian Chemical Society.
4. “Angelo Mangini” (Gold) Medal for Research 2010 of the Organic Chemistry (http://www.iupac.cnr.it/2-non-categorizzato/42-massimo-olivucci)

Тематика совместной научной работы
Целью командировки являлось продолжение совместной работы по разработке и синтезу нового оптического генетически-кодируемого нанобиосенсора мембранного потенциала на основе археородопсина-3.

Краткое описание полученных по итогам поездки результатов.

В рамках выполнения проекта проводился подбор мутантов археородопсина-3 с оптимальными спектральными характеристиками: а) Более интенсивным флуоресцентным сигналом; б) Спектром поглощения, сдвинутым в длинноволновую область. В ходе выполнения проекта был разработан алгоритм для автоматического предсказания мутанта археородопсина-3 со сдвинутым относительно дикого типа спектром поглощения. В основе метода лежит генетический алгоритм, который позволяет проводить направленную эволюцию белка (поиск мутанта белка с максимальным значением некоторой характеристики А, в данном случае А - сдвиг спектра поглощения в длинноволновую область). Алгоритм был протестирован на белке из семейства бактериальных родопсинов - G. violaceus родопсине, для которого имеются экспериментальные данные по сдвигу полосы поглощения белка методом направленной эволюции. Разработанный генетический алгоритм был успешно использован для автоматического предсказания мутантов археородопсина-3 со сдвинутым спектром поглощения.

Были наработаны методики по достижению экспрессии мутантов археородопсина-3 в прокариотических клетках, методики выделения белков из клеток для измерения их спектральных свойств. Были изучены спектральные свойства двух мутантов археородопсина-3, полученные на основании рационального вычислительного дизайна. Таким образом, основная цель командировки, а также все задачи были выполнены в полном объеме.
Короткий заголовокУниверситет Сиены, Италия
АббревиатураCOLLAB2019_2
СтатусЗавершено
Действительная дата начала/окончания10/06/199/07/19