Рогачева Ольга Николаевна

  • 32 всего цитирований публикаций, внесённых в Pure
  • 2 h-индекс по публикациям в Pure
20062020

Research output per year

Если Вы внесли какие-либо изменения в Pure, они скоро будут показаны здесь.

Результаты исследований

  • 32 всего цитирований публикаций, внесённых в Pure
  • 2 h-индекс по публикациям в Pure
  • 27 тезисы
  • 11 статья
  • 2 иная часть книжной публикации
  • 1 учебное-методическое пособие
2020

N-terminal SH3-domain of human Grb2 protein

Bolgov, A. A., Corban, S. A., Лузик, Д. А., Рогачева, О. Н., Zhemkov, V. A., Kim, M., Скрынников, Н. Р. & Bezprozvanny, I. B., 29 янв 2020

Результат исследований: Иные виды публикацийинаянаучная

Открытый доступ
2019

INFLUENCE OF ANTIMICROBIAL PEPTIDE ARENICIN-1 ON COMPLEMENT ACTIVATION

Umnyakova, E., Krenev, I., Sokolov, A., Gorbunov, N., Rogacheva, O., Ovchinnikova, T., Kokryakov, V. & Berlov, M., окт 2019, В : Molecular Immunology. 114, стр. 438-439 2 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхтезисы

Molecular Dynamics model of peptide-protein conjugation: case study of covalent complex between Sos1 peptide and N-terminal SH3 domain from Grb2

Лузик, Д. А., Рогачева, О. Н., Измайлов, С. А., Индейкина, М., Кононихин, А. С. & Скрынников, Н. Р., 27 дек 2019, В : Scientific Reports. 9, 18 стр., 20219.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Открытый доступ

Peptide-protein conjugation in the context of targeted therapy: modeling and experiment

Rogacheva, O., Luzik, D., Indeykina, M., Kononikhin, A. & Skrynnikov, N., июл 2019, В : FEBS Open Bio. 9, стр. 212-212 1 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхтезисы

When molecular dynamics met NMR (and various other experimental methods)

Рогачева, О. Н., Измайлов, С. А., Лузик, Д. А., Рабдано, С. О., Подкорытов, И. С., Slipchenko, L. V., Индейкина, М., Cunningham, T., Hasanbasri, Z., Saxena, S. & Скрынников, Н. Р., 2019, стр. 56-56. 1 стр.

Результат исследований: Материалы конференцийтезисы

ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ АРЕНИЦИНА-1 С БЕЛКОМ КОМПЛЕМЕНТА C3B

Umnyakova, E., Кренев, И. А., Легковой, С. В., Sokolov, A. V., Рогачева, О. Н., Ovchinnikova, T. V., Кокряков, В. Н. & Берлов, М. Н., 27 мая 2019, В : МЕДИЦИНСКИЙ АКАДЕМИЧЕСКИЙ ЖУРНАЛ. стр. 187-188 2 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхтезисы

Открытый доступ
2018

Analysis of crystallographic structures and DFT calculations reveal a new structural arrangement in proteins involving lysine NH3+ group and carbonyl

Скрынников, Н. Р., Измайлов, С. А., Слипченко, Л. & Рогачева, О. Н., 2018, В : Acta Crystallographica Section A: Foundations and Advances. 74, a1, стр. a175

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхтезисы

Открытый доступ

Conjugation of modified Sos1-derived peptide and N-terminal SH3-domain of adapter protein Grb2

Лузик, Д. А., Рогачева, О. Н., Измайлов, С. А. & Скрынников, Н. Р., 2018, стр. 304.

Результат исследований: Материалы конференцийтезисы

Covalent binding of modified Sos1-derived peptide and N-terminal SH3-domain of adapter protein Grb2

Luzik, D. A., Rogacheva, O. N., Izmailov, S. A., Indeykina, M. A., Tyuryaeva, I. I., Bushmanova, E. L., Podkorytov, I. S. & Skrynnikov, N. R., 2018, Актуальные проблемы трансляционной биомедицины - 2018: Сборник тезисов. СПБ.: Издательство Санкт-Петербургского университета, стр. 73

Результат исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийиная часть книжной публикации

Disulfide Bonds and how they Cause Protein Aggregation: Perspectives from NMR, Md Modeling and Cell Culture Experiments

Rabdano, S., Skrynnikov, N., Izmailov, S., Tyuryaeva, I., Luzik, D., Rogacheva, O., Lyublinskaya, O. & Podkorytov, I., 21 ноя 2018, В : Protein Science. 27, S1, стр. 43

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхтезисы

Many faces of disulfide bond

Рабдано, С. О., Измайлов, С. А., Лузик, Д. А., Рогачева, О. Н., Тюряева, И. И., Люблинская, О., Подкорытов, И. С. & Скрынников, Н. Р., 2018, стр. 48.

Результат исследований: Материалы конференцийтезисы

Биоконъюгация пептидов в контексте таргетной терапии: моделирование и эксперимент

Rogacheva, O. N., Luzik, D. A., Izmailov, S. A., Indeykina, M. A. & Skrynnikov, N. R., 2018, Актуальные проблемы трансляционной биомедицины - 2018: Сборник тезисов. СПб.: Издательство Санкт-Петербургского университета, стр. 59

Результат исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийиная часть книжной публикации

2017

A new structural arrangement in proteins involving lysine NH3+ group and carbonyl

Rogacheva, O. N., Izmailov, S. A., Slipchenko, L. V. & Skrynnikov, N. R., 2017, В : Scientific Reports. 7, 1, стр. 16402 8 стр.

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

2 Цитирования (Scopus)

Electrostatic Switch Function in the Mechanism of Protein Kinase A Iα Activation: Results of the Molecular Dynamics Simulation

Rogacheva, O. N., Shchegolev, B. F., Vershinina, E. A., Tokmakov, A. A. & Stefanov, V. E., 2017, В : BioMed Research International. 2017, 1-8

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

New linear interaction between charged lysine side chain and carbonyl group in protein structures

Rogacheva, O., Izmailov, S., Слипченко, Л. & Skrynnikov, N., сен 2017, В : FEBS Journal. 284, стр. 311-312

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхтезисы

Slow conformational exchange and overall rocking motion in ubiquitin protein crystals

Kurauskas, V., Izmailov, S. A., Rogacheva, O. N., Hessel, A., Ayala, I., Woodhouse, J., Shilova, A., Xue, Y., Yuwen, T., Coquelle, N., Colletier, J-P., Skrynnikov, N. R. & Schanda, P., 2017, В : Nature Communications. 8, 145 (2017).

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

25 Цитирования (Scopus)

Новое взаимодействие между группой NH3+ лизина и карбонилами основной цепи, дополняющее водородные связи.

Рогачева, О. Н., Измайлов, С. А., Скрынников, Н. Р. & Слипченко, Л., 15 июл 2017, стр. 61. 79 стр.

Результат исследований: Материалы конференцийтезисы

2016

Dynamics in Protein Crystals: Insights from MD Simulations Complement New Solid-State NMR and X-Ray Data.

Rogacheva, O. N., Izmailov, S. A., Kurauskas, V., Shilova, A., Ma, P., Xue, Y., Coquelle, N., Haller, J. D., Yuwen, T., Ayala, I., Hessel, A., Woodhouse, J., Mikhailovskii, O., Willbold, D., Colletier, J., Skrynnikov, N. R. & Schanda, P., 2016, В : FEBS Journal. 283, стр. 237

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхтезисы

Molecular dynamics studies and in silico mutational analysis as applied to dynamics in ubiquitin crystals

Рогачева, О. Н., Измайлов, С. А. & Скрынников, Н. Р., 2016, стр. 127.

Результат исследований: Материалы конференцийтезисы

Using molecular dynamics simulation and chemical shift prediction to unravel dynamics in different crystal forms of ubiquitin

Рогачева, О. Н., Измайлов, С. А., Kurauskas, V., Shilova, A., Ma, P., Xue, Y., Coquelle, N., Haller, J. D., Yuwen, T., Ayala, I., Hessel, A., Woodhouse, J., Mikhailovskii, O., Willbold, D., Colletier, J-P., Скрынников, Н. Р. & Schanda, P., 2016, стр. 43.

Результат исследований: Материалы конференцийтезисы

2015

cAMP-induced conformational changes of Protein kinase A Iα A-domain

Рогачева, О. Н., Стефанов, В. Е., Щеголев, Б. Ф. & Вершинина, Е. А., 2015, стр. 121.

Результат исследований: Материалы конференцийтезисы

2014

Role of Arginine 209 in the Conformational Transition of the Protein Kinase A Regulatory Subunit RIα A-domain

Rogacheva, O. N., Stefanov, V. E., Shchegolev, B. F., Vershinina, E. A. & Savvateeva-Popova, E. V., 2014, В : Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 12, 2, стр. 19

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

1 Цитирования (Scopus)
2013

Molecular dynamics study of A-domain of Protein Kinase A Iα

Stefanov, V., Rogacheva, O., Vershinina, E. & Shchegolev, B., июл 2013, В : FEBS Journal. 280, стр. 158-159

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхтезисы

Understanding cAMP-induced conformational transition of protein kinase A Iα A-domain. Role of the invariant R209

Стефанов, В. Е., Рогачева, О. Н., Щеголев, Б. Ф., Вершинина, Е. А., Михайлов, Г. В. & Савватеева-Попова, Е. В., 2013, стр. 176.

Результат исследований: Материалы конференцийтезисы

2012

3’:5’-AMP-индуцированный конформационный переход регуляторной субъединицы протеинкиназы А Ia запускается ключевыми остатками A202 И A326; Ч I.

Рогачева, О. Н., Щеголев, Б. Ф., Стефанов, В. Е., Захаров, Г. А. & Савватеева-Попова, E. B., 2012, В : БИОХИМИЯ. 77, 5, стр. 568-577

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Initiation of the 3′:5′-AMP-induced protein kinase A Iα regulatory subunit conformational transition. Part I. A202 and A326 are critical residues

Rogacheva, O. N., Shchegolev, B. F., Stefanov, V. E., Zakharov, G. A. & Savvateeva-Popova, E. V., 2012, В : Biochemistry (Moscow). 77, 5, стр. 456-464

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

3 Цитирования (Scopus)

Initiation of the 3′:5′-AMP-induced protein kinase A Iα regulatory subunit conformational transition. Part II. Inhibition by Rp-3′:5′-AMPS

Rogacheva, O. N., Shchegolev, B. F., Stefanov, V. E. & Savvateeva-Popova, E. V., 2012, В : Biochemistry (Moscow). 77, 5, стр. 465-468

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

1 Цитирования (Scopus)

Rp-3’:5’-AMPS блокирует начальные стадии конформационнного перехода регуляторной субъединицы протеинкиназы А Ia; Ч II

Рогачева, О. Н., Щеголев, Б. Ф., Стефанов, В. Е. & Савватеева-Попова, E. B., 2012, В : БИОХИМИЯ. 77, 5, стр. 578-582

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Theoretical modeling of protein-protein and ligand-protein interactions in silico. Molecular mechanism for protein kinase A Iα A-domain activation

Рогачева, О. Н., Стефанов, В. Е., Щеголев, Б. Ф. & Савватеева-Попова, Е. В., 2012, стр. 33-34.

Результат исследований: Материалы конференцийтезисы

Построение модели конформационного перехода А-домена регуляторной субъединицы протеинкиназы А Iα

Рогачева, О. Н., Щеголев, Б. Ф., Стефанов, В. Е., Михайлов, Г. В. & Савватеева-Попова, E. B., 2012, стр. 772-774.

Результат исследований: Материалы конференцийтезисы

2011

Моделирование конформационных переходов цАМФ-связывающих доменов протеинкиназы А Iα (ПКА Iα)

Рогачева, О. Н., Савватеева-Попова, Е. В. & Щеголев, Б. Ф., 2011, стр. 131.

Результат исследований: Материалы конференцийтезисы

2010

A brief view into protein kinase A Iα activation process

Rogacheva, O. N., ноя 2010, В : European Cells and Materials. 20, SUPPL.3, стр. 215

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхтезисы

Thermodynamic analysis of protein kinase A Iα activation

Rogacheva, O. N., Popov, A. V., Savvateeva-Popova, E. V., Stefanov, V. E. & Shchegolev, B. F., 2010, В : Biochemistry (Moscow). 75, 2, стр. 233-241

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Квантово-химический анализ ингибирования протеинкиназы А Iα Rp-цАМФS

Рогачева, О. Н., Савватеева-Попова, Е. В. & Щеголев, Б. Ф., 2010, стр. 517-518.

Результат исследований: Материалы конференцийтезисы

2009

Computer simulation and quantum chemistry calculations in the analysis of the physical mechanism of the biologically significant activity of nucleotides

Стефанов, В. Е., Рогачева, О. Н. & Тулуб, А. А., 2009, стр. 339-340.

Результат исследований: Материалы конференцийтезисы

Термодинамическая оценка активации протеинкиназы А Iα (ПКА Iα). Анализ роли стэкинг-взаимодействия в связывании цАМФ регуляторной субъединицей ПКА Iα.

Рогачева, О. Н., Попов, А. В., Щеголев, Б. Ф. & Савватеева-Попова, Е. В., 2009, стр. 102.

Результат исследований: Материалы конференцийтезисы

2008

Molecular modeling study of protein kinase A Iα (PKA Iα) and cyclic adenosine monophosphate (cAMP) interactions

Рогачева, О. Н., Попов, А. В., Савватеева-Попова, Е. В. & Щеголев, Б. Ф., 2008, стр. 126-127.

Результат исследований: Материалы конференцийтезисы

Исследование структуры и свойств биологических молекул методами вычислительной химии

Стефанов, В. Е., Рогачева, О. Н. & Щеголев, Б. Ф., 2008, Золотое сечение.

Результат исследований: Книги, отчёты, сборникиучебное-методическое пособие

2006

Влияние α-дефенсинов человека на экспрессию генов цитокинов мононуклуарами крови крыс в условиях стрессорного воздействия

Рогачева, О. Н. & Алешина, Г. М., 2006, В : Medical Immunology (Russia). 8, 2-3, стр. 115-116

Результат исследований: Научные публикации в периодических изданияхтезисы