Дмитрий Юрьевич Антипов

Результат исследований по году

Если Вы внесли какие-либо изменения в Pure, они скоро будут показаны здесь.

«Отпечаток»

Узнайте самые подробные результаты анализа активности Дмитрий Юрьевич Антипов. Указанные в этом разделе метки относятся к работам этого человека. Вместе они формируют уникальную картину активности.

1 похожих профилей - всего

2 Всего активных проектов
9 Всего завершенных проектов

RSF_RG_2019 - 4: Адаптация семейства программ SPAdes для использования новейших технологий, применяемых в анализе и сборке геномных, метагеномных и транскриптомных данных: 2022 г. этап 4
Коробейников, А. И., Лапидус, А. Л., Дворкина, Т. Е., Толстоганов, И. Н., Пржибельский, А. Д., Антипов, Д. Ю., Кунявская, О. А., Бушманова, Е. А. & Мелешко, Д. А.
17/05/22 → 31/12/22
Проект: исполнение гранта/договора › исполнение этапа гранта/договора
Mega_SPbU_2015 - 8: Лаборатория "Центр биоинформатики и алгоритмической биотехнологии" в СПбГУ: 2022 г. этап 8
Певзнер, П. А., Лапидус, А. Л., Коробейников, А. И., Михеенко, А. А., Пржибельский, А. Д., Гуревич, А. А., Антипов, Д. Ю., Райко, М. П., Дворкина, Т. Е., Тагирджанов, А. М., Толстоганов, И. Н., Александров, И. А., Мелешко, Д. А., Шафранская, Д. Д., Бушманова, Е. А., Кунявская, О. А. & Очкалова, С. Д.
1/01/22 → 31/12/22
Проект: исполнение гранта/договора › исполнение этапа гранта/договора
Mega_SPbU_2015 - 7: Лаборатория "Центр биоинформатики и алгоритмической биотехнологии" в СПбГУ: 2021 г. этап 7
Певзнер, П. А., Лапидус, А. Л., Коробейников, А. И., Михеенко, А. А., Пржибельский, А. Д., Гуревич, А. А., Антипов, Д. Ю., Райко, М. П., Дворкина, Т. Е., Тагирджанов, А. М., Толстоганов, И. Н., Александров, И. А., Мелешко, Д. А., Шафранская, Д. Д., Бушманова, Е. А. & Кунявская, О. А.
1/01/21 → 31/12/21
Проект: исполнение гранта/договора › исполнение этапа гранта/договора
RSF_RG_2019 - 3: Адаптация семейства программ SPAdes для использования новейших технологий, применяемых в анализе и сборке геномных, метагеномных и транскриптомных данных: 2021 г. этап 3
Коробейников, А. И., Лапидус, А. Л., Дворкина, Т. Е., Толстоганов, И. Н., Пржибельский, А. Д., Антипов, Д. Ю., Кунявская, О. А., Бушманова, Е. А. & Мелешко, Д. А.
1/01/21 → 31/12/21
Проект: исполнение гранта/договора › исполнение этапа гранта/договора
RFBR_EMBL_2018 - 3: Высокопроизводительная цепочка анализа метагеномов в EBI на базе инструментов семейства SPAdes: 2020 г. этап 3
Коробейников, А. И., Антипов, Д. Ю., Лапидус, А. Л., Пржибельский, А. Д., Бушманова, Е. А. & Кунявская, О. А.
23/09/20 → 9/09/21
Проект: исполнение гранта/договора › исполнение этапа гранта/договора

12966 всего цитирований публикаций, внесённых в Pure
11 h-индекс по публикациям в Pure
16 статья
2 тезисы

Critical Assessment of Metagenome Interpretation: the second round of challenges
Meyer, F., Fritz, A., Deng, Z. L., Koslicki, D., Lesker, T. R., Gurevich, A., Robertson, G., Alser, M., Antipov, D., Beghini, F., Bertrand, D., Brito, J. J., Brown, C. T., Buchmann, J., Buluç, A., Chen, B., Chikhi, R., Clausen, P. T. L. C., Cristian, A., Dabrowski, P. W. и 83 др., Darling, A. E., Egan, R., Eskin, E., Georganas, E., Goltsman, E., Gray, M. A., Hansen, L. H., Hofmeyr, S., Huang, P., Irber, L., Jia, H., Jørgensen, T. S., Kieser, S. D., Klemetsen, T., Kola, A., Kolmogorov, M., Korobeynikov, A., Kwan, J., LaPierre, N., Lemaitre, C., Li, C., Limasset, A., Malcher-Miranda, F., Mangul, S., Marcelino, V. R., Marchet, C., Marijon, P., Meleshko, D., Mende, D. R., Milanese, A., Nagarajan, N., Nissen, J., Nurk, S., Oliker, L., Paoli, L., Peterlongo, P., Piro, V. C., Porter, J. S., Rasmussen, S., Rees, E. R., Reinert, K., Renard, B., Robertsen, E. M., Rosen, G. L., Ruscheweyh, H. J., Sarwal, V., Segata, N., Seiler, E., Shi, L., Sun, F., Sunagawa, S., Sørensen, S. J., Thomas, A., Tong, C., Trajkovski, M., Tremblay, J., Uritskiy, G., Vicedomini, R., Wang, Z., Wang, Z., Wang, Z., Warren, A., Willassen, N. P., Yelick, K., You, R., Zeller, G., Zhao, Z., Zhu, S., Zhu, J., Garrido-Oter, R., Gastmeier, P., Hacquard, S., Häußler, S., Khaledi, A., Maechler, F., Mesny, F., Radutoiu, S., Schulze-Lefert, P., Smit, N., Strowig, T., Bremges, A., Sczyrba, A. & McHardy, A. C., 8 апр 2022, В: Nature Methods. 19, 4, стр. 429-440 18 стр.
Результат исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Открытый доступ
Analysis of metagenome-assembled viral genomes from the human gut reveals diverse putative CrAss-like phages with unique genomic features
Yutin, N., Benler, S., Shmakov, S. A., Wolf, Y. I., Tolstoy, I., Rayko, M., Antipov, D., Pevzner, P. A. & Koonin, E. V., дек 2021, В: Nature Communications. 12, 1, 11 стр., 1044.
Результат исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Открытый доступ
11 Цитирования (Scopus)
Thousands of previously unknown phages discovered in whole-community human gut metagenomes
Benler, S., Yutin, N., Antipov, D., Rayko, M., Shmakov, S., Gussow, A. B., Pevzner, P. & Koonin, E. V., дек 2021, В: Microbiome. 9, 1, 17 стр., 78.
Результат исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Открытый доступ
10 Цитирования (Scopus)
Black cat in a dark room: search for new viruses in metagenomes
Яковлева, Ю. А., Забелкин, А., Сказина, М. А., Калтович, А., Антипов, Д. Ю. & Райко, М. П., 17 дек 2020, В: BMC Bioinformatics. 21, Suppl.20
Результат исследований: Научные публикации в периодических изданиях › тезисы › рецензирование

Открытый доступ
Extending rnaSPAdes functionality for hybrid transcriptome assembly
Prjibelski, A. D., Puglia, G. D., Antipov, D., Bushmanova, E., Giordano, D., Mikheenko, A., Vitale, D. & Lapidus, A., 24 июл 2020, В: BMC Bioinformatics. 21, Suppl 12, стр. 302 9 стр., 302.
Результат исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Открытый доступ
6 Цитирования (Scopus)

15 выступление с устной презентацией

metaplasmidSPAdes: Plasmid Detection and Assembly in Genomic and Metagenomic Datasets
Дмитрий Юрьевич Антипов (Основной докладчик), Михаил Петрович Райко (Докладчик), Алла Львовна Лапидус (Докладчик) & Павел Аркадьевич Певзнер (Докладчик)
27 июл 2019 → 30 июл 2019
Деятельность: выступление › выступление с устной презентацией
SPAligner: alignment of long diverged molecular sequences to assembly graphs
Дмитрий Юрьевич Антипов (Основной докладчик), Татьяна Евгеньевна Дворкина (Докладчик), Антон Иванович Коробейников (Докладчик) & Сергей Юрьевич Нурк (Докладчик)
20 июн 2019
Деятельность: выступление › выступление с устной презентацией
Versatile genome assembly evaluation with QUAST-LG
Алексей Александрович Гуревич (Основной докладчик), Алла Александровна Михеенко (Докладчик), Андрей Дмитриевич Пржибельский (Докладчик), Дмитрий Юрьевич Антипов (Докладчик) & Владислав Владимирович Савельев (Докладчик)
16 июл 2018 → 19 июл 2018
Деятельность: выступление › выступление с устной презентацией
Versatile genome assembly evaluation with QUAST-LG
Алла Александровна Михеенко (Докладчик), Алексей Александрович Гуревич (Основной докладчик), Андрей Дмитриевич Пржибельский (Докладчик), Дмитрий Юрьевич Антипов (Докладчик) & Владислав Владимирович Савельев (Докладчик)
9 июл 2018
Деятельность: выступление › выступление с устной презентацией
GAligner: инструмент для эффективного и точного выравнивания длинных ридов на граф сборки
Татьяна Евгеньевна Дворкина (Докладчик), Дмитрий Юрьевич Антипов (Докладчик), Антон Иванович Коробейников (Докладчик) & Сергей Юрьевич Нурк (Докладчик)
20 июл 2018 → 22 июл 2018
Деятельность: выступление › выступление с устной презентацией

Антипов Дмитрий Юрьевич

«Отпечаток»

Сотрудничество

Подробнее

Mega_SPbU_2015 - 8: Лаборатория "Центр биоинформатики и алгоритмической биотехнологии" в СПбГУ: 2022 г. этап 8

Mega_SPbU_2015 - 7: Лаборатория "Центр биоинформатики и алгоритмической биотехнологии" в СПбГУ: 2021 г. этап 7

RFBR_EMBL_2018 - 3: Высокопроизводительная цепочка анализа метагеномов в EBI на базе инструментов семейства SPAdes: 2020 г. этап 3

Critical Assessment of Metagenome Interpretation: the second round of challenges

Analysis of metagenome-assembled viral genomes from the human gut reveals diverse putative CrAss-like phages with unique genomic features

Thousands of previously unknown phages discovered in whole-community human gut metagenomes

Black cat in a dark room: search for new viruses in metagenomes

Extending rnaSPAdes functionality for hybrid transcriptome assembly

metaplasmidSPAdes: Plasmid Detection and Assembly in Genomic and Metagenomic Datasets

SPAligner: alignment of long diverged molecular sequences to assembly graphs

Versatile genome assembly evaluation with QUAST-LG

Versatile genome assembly evaluation with QUAST-LG

GAligner: инструмент для эффективного и точного выравнивания длинных ридов на граф сборки

Антипов Дмитрий Юрьевич

«Отпечаток»

Сотрудничество

Проекты

Результаты исследований

Виды деятельности