Проекты за года
«Отпечаток»
- 1 похожих профилей - всего
Сотрудничество
-
Minobrnauka_INTER_2021 - 1: Развитие методов вычислительной геномики для работы с большими данными секвенирования второго и третьего поколений: 2022 г. этап 1
Коробейников, А. И., Лапидус, А. Л., Пржибельский, А. Д., Гуревич, А. А., Кунявская, О. А., Толстоганов, И. Н., Мелешко, Д. А., Михеенко, А. А., Тагирджанов, А. М. & Бушманова, Е. А.
15/04/22 → 31/12/22
Проект: исполнение гранта/договора › исполнение этапа гранта/договора
-
Mega_SPbU_2015 - 8: Лаборатория "Центр биоинформатики и алгоритмической биотехнологии" в СПбГУ: 2022 г. этап 8
Певзнер, П. А., Лапидус, А. Л., Коробейников, А. И., Михеенко, А. А., Пржибельский, А. Д., Гуревич, А. А., Антипов, Д. Ю., Райко, М. П., Дворкина, Т. Е., Тагирджанов, А. М., Толстоганов, И. Н., Александров, И. А., Мелешко, Д. А., Шафранская, Д. Д., Бушманова, Е. А. & Кунявская, О. А.
Проект: исполнение гранта/договора › исполнение этапа гранта/договора
-
RSF_RG_2019 - 3: Адаптация семейства программ SPAdes для использования новейших технологий, применяемых в анализе и сборке геномных, метагеномных и транскриптомных данных: 2021 г. этап 3
Коробейников, А. И., Лапидус, А. Л., Дворкина, Т. Е., Толстоганов, И. Н., Пржибельский, А. Д., Антипов, Д. Ю., Кунявская, О. А., Бушманова, Е. А. & Мелешко, Д. А.
1/01/21 → 31/12/21
Проект: исполнение гранта/договора › исполнение этапа гранта/договора
-
Mega_SPbU_2015 - 7: Лаборатория "Центр биоинформатики и алгоритмической биотехнологии" в СПбГУ: 2021 г. этап 7
Певзнер, П. А., Лапидус, А. Л., Коробейников, А. И., Михеенко, А. А., Пржибельский, А. Д., Гуревич, А. А., Антипов, Д. Ю., Райко, М. П., Дворкина, Т. Е., Тагирджанов, А. М., Толстоганов, И. Н., Александров, И. А., Мелешко, Д. А., Шафранская, Д. Д., Бушманова, Е. А. & Кунявская, О. А.
1/01/21 → 31/12/21
Проект: исполнение гранта/договора › исполнение этапа гранта/договора
-
RFBR_a_2019 - 2: Сборка и анализ баркодированных данных транскриптомного секвенирования: 2020 г. этап 2
Пржибельский, А. Д., Мелешко, Д. А., Антипов, Д. Ю. & Бушманова, Е. А.
27/03/20 → 26/12/20
Проект: исполнение гранта/договора › исполнение этапа гранта/договора
Результаты исследований
- 1431 всего цитирований публикаций, внесённых в Pure
- 6 h-индекс по публикациям в Pure
- 9 статья
-
Critical Assessment of Metagenome Interpretation: the second round of challenges
Meyer, F., Fritz, A., Deng, Z. L., Koslicki, D., Lesker, T. R., Gurevich, A., Robertson, G., Alser, M., Antipov, D., Beghini, F., Bertrand, D., Brito, J. J., Brown, C. T., Buchmann, J., Buluç, A., Chen, B., Chikhi, R., Clausen, P. T. L. C., Cristian, A., Dabrowski, P. W. и 83 др., , 8 апр 2022, В: Nature Methods. 19, 4, стр. 429-440 18 стр.Результат исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование
Открытый доступ -
Petabase-scale sequence alignment catalyses viral discovery
Edgar, R. C., Taylor, J., Lin, V., Altman, T., Barbera, P., Meleshko, D., Lohr, D., Novakovsky, G., Buchfink, B., Al-Shayeb, B., Banfield, J. F., de la Peña, M., Korobeynikov, A., Chikhi, R. & Babaian, A., 3 фев 2022, В: Nature. 602, 7895, стр. 142-147 25 стр.Результат исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование
Открытый доступ3 Цитирования (Scopus) -
coronaSPAdes: from biosynthetic gene clusters to RNA viral assemblies
Meleshko, D., Hajirasouliha, I. & Korobeynikov, A., окт 2021, В: Bioinformatics. btab597.Результат исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование
-
Cartography of opportunistic pathogens and antibiotic resistance genes in a tertiary hospital environment
MetaSUB Consortium, 8 июн 2020, (Электронная публикация перед печатью) В: Nature Medicine.Результат исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование
Открытый доступ45 Цитирования (Scopus) -
Using SPAdes De Novo Assembler
Prjibelski, A., Antipov, D., Meleshko, D., Lapidus, A. & Korobeynikov, A., 19 июн 2020, (Электронная публикация перед печатью) В: Current Protocols in Bioinformatics. 70, 1, e102.Результат исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование
118 Цитирования (Scopus)
Виды деятельности
- 5 выступление с устной презентацией
-
Transcriptome assembly with spISO-seq data
Андрей Дмитриевич Пржибельский (Основной докладчик), Дмитрий Алексеевич Мелешко (Докладчик), Елена Алексеевна Бушманова (Докладчик) & Hagen Tilgner (Докладчик)
28 июл 2019Деятельность: выступление › выступление с устной презентацией
-
BiosyntheticSPAdes: Reconstructing Biosynthetic Gene Clusters From Assembly Graphs
Дмитрий Алексеевич Мелешко (Основной докладчик), Антон Иванович Коробейников (Докладчик) & Павел Аркадьевич Певзнер (Докладчик)
16 июл 2018Деятельность: выступление › выступление с устной презентацией
-
SPAdes Family of Tools for Genome Assembly and Analysis: What's New?
Антон Иванович Коробейников (Основной докладчик), Дмитрий Юрьевич Антипов (Докладчик), Елена Алексеевна Бушманова (Докладчик), Алексей Александрович Гуревич (Докладчик), Алла Львовна Лапидус (Докладчик), Алла Александровна Михеенко (Докладчик), Дмитрий Алексеевич Мелешко (Докладчик), Сергей Юрьевич Нурк (Докладчик), Андрей Дмитриевич Пржибельский (Докладчик) & Павел Аркадьевич Певзнер (Докладчик)
15 фев 2018Деятельность: выступление › выступление с устной презентацией
-
SPAdes Family of Tools for Genome Assembly and Analysis: Current Status
Антон Иванович Коробейников (Основной докладчик), Дмитрий Юрьевич Антипов (Докладчик), Елена Алексеевна Бушманова (Докладчик), Алексей Александрович Гуревич (Докладчик), Алла Львовна Лапидус (Докладчик), Алла Александровна Михеенко (Докладчик), Дмитрий Алексеевич Мелешко (Докладчик), Сергей Юрьевич Нурк (Докладчик), Дмитрий Алексеевич Мелешко (Докладчик) & Павел Аркадьевич Певзнер (Докладчик)
18 мая 2018Деятельность: выступление › выступление с устной презентацией
-
Graph-centric tools for genome analysis on top of SPAdes toolbox
Антон Иванович Коробейников (Основной докладчик), Александр Юрьевич Шлемов (Докладчик) & Дмитрий Алексеевич Мелешко (Докладчик)
24 мая 2018Деятельность: выступление › выступление с устной презентацией