Critical Assessment of Metagenome Interpretation - A benchmark of metagenomics software

Sczyrba, A., Hofmann, P., Belmann, P., Koslicki, D., Janssen, S., Dröge, J., Gregor, I., Majda, S., Fiedler, J., Dahms, E., Bremges, A., Fritz, A., Garrido-Oter, R., Jørgensen, T. S., Shapiro, N., Blood, P. D., Gurevich, A., Bai, Y., Turaev, D., Demaere, M. Z. еще 47, Chikhi, R., Nagarajan, N., Quince, C., Meyer, F., Balvočiutė, M., Hansen, L. H., Sørensen, S. J., Chia, B. K. H., Denis, B., Froula, J. L., Wang, Z., Egan, R., Don Kang, D., Cook, J. J., Deltel, C., Beckstette, M., Lemaitre, C., Peterlongo, P., Rizk, G., Lavenier, D., Wu, Y. W., Singer, S. W., Jain, C., Strous, M., Klingenberg, H., Meinicke, P., Barton, M. D., Lingner, T., Lin, H. H., Liao, Y. C., Silva, G. G. Z., Cuevas, D. A., Edwards, R. A., Saha, S., Piro, V. C., Renard, B. Y., Pop, M., Klenk, H. P., Göker, M., Kyrpides, N. C., Woyke, T., Vorholt, J. A., Schulze-Lefert, P., Rubin, E. M., Darling, A. E., Rattei, T. & McHardy, A. C., 31 окт 2017, в: Nature Methods. 14, 11, стр. 1063-1071 9 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Metabolic Fingerprints from the Human Oral Microbiome Reveal a Vast Knowledge Gap of Secreted Small Peptidic Molecules

Edlund, A., Garg, N., Mohimani, H., Gurevich, A., He, X., Shi, W., Dorrestein, P. C. & McLean, J. S., 29 авг 2017, в: mSystems. 2, 4, e00058.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

MetaSPAdes: A new versatile metagenomic assembler

Nurk, S., Мелешко, Д. А., Korobeynikov, A. & Pevzner, P. A., 1 мая 2017, в: Genome Research. 27, 5, стр. 824-834 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Comparative genomics uncovers the prolific and distinctive metabolic potential of the cyanobacterial genus Moorea

Leao, T., Castelão, G., Korobeynikov, A., Monroe, E. A., Podell, S., Glukhov, E., Allen, E. E., Gerwick, W. H. & Gerwick, L., 21 мар 2017, в: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 114, 12, стр. 3198-3203 6 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Dereplication of peptidic natural products through database search of mass spectra

Mohimani, H., Gurevich, A., Mikheenko, A., Garg, N., Nothias, L. F., Ninomiya, A., Takada, K., Dorrestein, P. C. & Pevzner, P. A., 1 янв 2017, в: Nature Chemical Biology. 13, 1, стр. 30-37 8 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Reconstructing Antibody Repertoires from Error-Prone Immunosequencing Reads

Shlemov, A., Bankevich, S., Bzikadze, A., Turchaninova, M. A., Safonova, Y. & Pevzner, P. A., 2017, в: Journal of Immunotherapy. 199, 9, стр. 396-397

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Semi-nonparametric singular spectrum analysis with projection

Golyandina, N. & Shlemov, A., 2017, в: Statistics and its Interface. 10, 1, стр. 47-57

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

PlasmidSPAdes: Assembling plasmids from whole genome sequencing data

Antipov, D., Hartwick, N., Shen, M., Raiko, M., Lapidus, A. & Pevzner, P. A., 15 ноя 2016, в: Bioinformatics. 32, 22, стр. 3380-3387 8 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Icarus: Visualizer for de novo assembly evaluation

Mikheenko, A., Valin, G., Prjibelski, A., Saveliev, V. & Gurevich, A., 1 ноя 2016, в: Bioinformatics. 32, 21, стр. 3321-3323 3 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование