Несмотря на успехи современных методов секвенирования и биоинформатических инструментов для сборки геномов, центромерные участки хромосом не поддаются расшифровке из-за обогащенности тандемными повторами и часто опускаются в полногеномных аннотациях. Поэтому изучение центромерных участков требует разработки программ, способных идентифицировать тандемные повторы, а положение найденных последовательностей необходимо подтверждать с помощью цитогенетических методов. Ранее мы охарактеризовали тандемные повторы у зебровой амадины (Taeniopygia guttata), модельного объекта нейробиологии, биологии поведения и эволюционной геномики. Нам удалось описать тандемные повторы Tgut191A и Tgut716A и картировать их в области центромеры на митотических хромосомах. Мы показали, что Tgut716A и Tgut191A в разном соотношении представлены на макрохромосомах, а повтор Tgut716A более распространен в микрохромосомах и центромерных участках половых хромосом Z и W. Для более детальной характеристики повторов Tgut191A и Tgut716 мы провели их высокоразрешающее картирование на хромосомах типа ламповых щеток (ЛЩ) методом FISH. Как и ожидалось, при гибридизации с Tgut191A и Tgut716A мы наблюдали яркие сигналы в макрохромосомах, что позволило соотнести не описанные ранее хромосомы типа ЛЩ зебровой амадины с их метафазными формами по распределению сигналов центромерных зондов и центромерному индексу. В составе микрохромосом ЛЩ сигналы от зондов Tgut191A и Tgut716A обнаруживаются не только в центромерных, но и в субтеломерных участках в области хиазм, а также наблюдается накопление РНК-продуктов повторов Tgut191A и Tgut716A на хромосомах и особых РНК-накапливающих структурах – терминальных гигантских петлях.
Среди птиц присутствие центромерных последовательностей в субтеломерных участках хромосом уже было описано при высокоразрешающем картировании центромерных повторов РО41 и BglII на хромосомах типа ЛЩ у японского перепела, а также при картировании повтора CNM у домашней курицы. Эти данные, полученные для хромосом трёх самых изученных видов птиц, могут свидетельствовать о том, что среди птиц накопление одинаковых тандемных повторов в субтеломерных и центромерных участках – это распространенное явление, которое не было описано раннее в связи с малоизученностью центромерных последовательностей в целом.
