Центр защиты прав абитуриента оказался востребованным, когда российское образование переходило на принципиально новую систему приёма в образовательные учреждения высшего образования по результатам Единого государственного экзамена. Введение новой формы вступительных испытаний потребовало адаптации к ней. Нововведение породило много организационных и, как следствие, правовых проблем в социально чувствительной сфере. Создание Центра защиты прав абитуриента стало оперативным воплощением идеи о необходимости оперативного реагирования на существенные изменения в сфере регулирования образовательного права и потенциально возможные в связи с этим нарушения прав абитуриентов.