РАЗРАБОТКА ДРОЖЖЕВОЙ МОДЕЛИ ДЛЯ ФЕНОТИПИЧЕСКОГО АНАЛИЗА КОНФОРМАЦИОННЫХ ПЕРЕКЛЮЧЕНИЙ БЕЛКА PrP.

Research outputpeer-review

Abstract

Целый ряд заболеваний человека и животных, получивших название амилоидозы, возникает из-за «неправильной» укладки и агрегации белков (амилоидов). В настоящее время насчитывается более 50 амилоидозов. К наиболее социально значимым амилоидозам относятся болезнь Альцгеймера, болезнь Паркинсона, боковой амиотрофический склероз, диабет II типа. В особую группу выделяют прионные заболевания (инфекционные амилоидозы), связанные с агрегацией и передачей между организмами прионного белка PrP. Подавляющее большинство амилоидных заболеваний на сегодняшний день неизлечимо. Удобным модельным объектом для изучения амилоидов млекопитающих in vivo являются дрожжи Saccharomyces cerevisiae, так как формируемые в дрожжах агрегаты в большинстве случаев не токсичны для клеток и сходны по биохимическим характеристикам с агрегатами, выявляемыми у млекопитающих [1] , [2]. Однако агрегаты амилоидных белков млекопитающих не имеют собственного фенотипического проявления в дрожжах. В нашей лаборатории разрабатывается дрожжевая модель, позволяющая по фенотипу «рост/отсутствие роста на селективных средах» оценивать амилоидогенный статус белков и проводить масштабный поиск факторов, влияющих на процессы амилоидогенеза. В качестве репортера мы используем C-терминальную последовательность дрожжевого фактора терминации трансляции - Sup35. В штаммах, маркированных нонсенс-мутацией ade1-14 и несущих делецию хромосомной копии SUP35, гибридный белок, включающий последовательность изучаемого амилоидогенного белка и репортерную последовательность, должен эффективно выполнять функции терминатора трансляции, что можно детектировать по отсутствию роста дрожжей на селективной среде без аденина. Агрегация амилоидогенного белка будет приводить к росту штаммов на селективной среде. В рамках данной работы нами разрабатывается дрожжевая модель для фенотипического анализа агрегации приона млекопитающих - PrP.
Благодарности: Данная работа была выполнена при поддержке проекта 15.61.2218.2013 (СПбГУ) и ресурсных центров «ЦКП ХРОМАС» и «РМиКТ» научного парка СПбГУ.
[1] Chandramowlishwaran P. et al., Mammalian amyloidogenic proteins promote prion nucleation in yeast. // 2018, J. Biol. Chem. V. 293(9), P. 3436-3450.
[2] Rubel A. et al., Identification of PrP sequences essential for the interaction between the PrP polymers and Aβ peptide in a yeast-based assay. // 2013, Prion, 7(6), P. 469–476.
Original languageRussian
Title of host publicationVII Съезд Вавилонского общества генетиков и селекционеров (ВОГиС)
Subtitle of host publicationСборник тезисов
Place of PublicationСПб.
Pages750
Publication statusPublished - 18 Jun 2019
EventМеждународный конгресс «VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы»: ВОГиС 2019 - Санкт-Петербург
Duration: 18 Jun 201922 Jun 2019
https://events.spbu.ru/events/genetic-selection-2019

Conference

ConferenceМеждународный конгресс «VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы»
Abbreviated titleВОГиС 2019
CountryRussian Federation
CityСанкт-Петербург
Period18/06/1922/06/19
Internet address

Scopus subject areas

  • Genetics

Cite this

Лашкул, В. В., Качкин, Д. В., Чернов, Ю. О., & Рубель, А. А. (2019). РАЗРАБОТКА ДРОЖЖЕВОЙ МОДЕЛИ ДЛЯ ФЕНОТИПИЧЕСКОГО АНАЛИЗА КОНФОРМАЦИОННЫХ ПЕРЕКЛЮЧЕНИЙ БЕЛКА PrP. In VII Съезд Вавилонского общества генетиков и селекционеров (ВОГиС): Сборник тезисов (pp. 750). СПб..
Лашкул, В.В. ; Качкин, Д.В. ; Чернов, Ю.О. ; Рубель, А.А. / РАЗРАБОТКА ДРОЖЖЕВОЙ МОДЕЛИ ДЛЯ ФЕНОТИПИЧЕСКОГО АНАЛИЗА КОНФОРМАЦИОННЫХ ПЕРЕКЛЮЧЕНИЙ БЕЛКА PrP. VII Съезд Вавилонского общества генетиков и селекционеров (ВОГиС): Сборник тезисов. СПб., 2019. pp. 750
@inproceedings{bd42ca225ba744d78e8c022c7aa3fa3f,
title = "РАЗРАБОТКА ДРОЖЖЕВОЙ МОДЕЛИ ДЛЯ ФЕНОТИПИЧЕСКОГО АНАЛИЗА КОНФОРМАЦИОННЫХ ПЕРЕКЛЮЧЕНИЙ БЕЛКА PrP.",
abstract = "Целый ряд заболеваний человека и животных, получивших название амилоидозы, возникает из-за «неправильной» укладки и агрегации белков (амилоидов). В настоящее время насчитывается более 50 амилоидозов. К наиболее социально значимым амилоидозам относятся болезнь Альцгеймера, болезнь Паркинсона, боковой амиотрофический склероз, диабет II типа. В особую группу выделяют прионные заболевания (инфекционные амилоидозы), связанные с агрегацией и передачей между организмами прионного белка PrP. Подавляющее большинство амилоидных заболеваний на сегодняшний день неизлечимо. Удобным модельным объектом для изучения амилоидов млекопитающих in vivo являются дрожжи Saccharomyces cerevisiae, так как формируемые в дрожжах агрегаты в большинстве случаев не токсичны для клеток и сходны по биохимическим характеристикам с агрегатами, выявляемыми у млекопитающих [1] , [2]. Однако агрегаты амилоидных белков млекопитающих не имеют собственного фенотипического проявления в дрожжах. В нашей лаборатории разрабатывается дрожжевая модель, позволяющая по фенотипу «рост/отсутствие роста на селективных средах» оценивать амилоидогенный статус белков и проводить масштабный поиск факторов, влияющих на процессы амилоидогенеза. В качестве репортера мы используем C-терминальную последовательность дрожжевого фактора терминации трансляции - Sup35. В штаммах, маркированных нонсенс-мутацией ade1-14 и несущих делецию хромосомной копии SUP35, гибридный белок, включающий последовательность изучаемого амилоидогенного белка и репортерную последовательность, должен эффективно выполнять функции терминатора трансляции, что можно детектировать по отсутствию роста дрожжей на селективной среде без аденина. Агрегация амилоидогенного белка будет приводить к росту штаммов на селективной среде. В рамках данной работы нами разрабатывается дрожжевая модель для фенотипического анализа агрегации приона млекопитающих - PrP.Благодарности: Данная работа была выполнена при поддержке проекта 15.61.2218.2013 (СПбГУ) и ресурсных центров «ЦКП ХРОМАС» и «РМиКТ» научного парка СПбГУ.[1] Chandramowlishwaran P. et al., Mammalian amyloidogenic proteins promote prion nucleation in yeast. // 2018, J. Biol. Chem. V. 293(9), P. 3436-3450.[2] Rubel A. et al., Identification of PrP sequences essential for the interaction between the PrP polymers and Aβ peptide in a yeast-based assay. // 2013, Prion, 7(6), P. 469–476.",
author = "В.В. Лашкул and Д.В. Качкин and Ю.О. Чернов and А.А. Рубель",
year = "2019",
month = "6",
day = "18",
language = "русский",
isbn = "9785965112371",
pages = "750",
booktitle = "VII Съезд Вавилонского общества генетиков и селекционеров (ВОГиС)",

}

Лашкул, ВВ, Качкин, ДВ, Чернов, ЮО & Рубель, АА 2019, РАЗРАБОТКА ДРОЖЖЕВОЙ МОДЕЛИ ДЛЯ ФЕНОТИПИЧЕСКОГО АНАЛИЗА КОНФОРМАЦИОННЫХ ПЕРЕКЛЮЧЕНИЙ БЕЛКА PrP. in VII Съезд Вавилонского общества генетиков и селекционеров (ВОГиС): Сборник тезисов. СПб., pp. 750, Санкт-Петербург, 18/06/19.

РАЗРАБОТКА ДРОЖЖЕВОЙ МОДЕЛИ ДЛЯ ФЕНОТИПИЧЕСКОГО АНАЛИЗА КОНФОРМАЦИОННЫХ ПЕРЕКЛЮЧЕНИЙ БЕЛКА PrP. / Лашкул, В.В.; Качкин, Д.В.; Чернов, Ю.О.; Рубель, А.А.

VII Съезд Вавилонского общества генетиков и селекционеров (ВОГиС): Сборник тезисов. СПб., 2019. p. 750.

Research outputpeer-review

TY - GEN

T1 - РАЗРАБОТКА ДРОЖЖЕВОЙ МОДЕЛИ ДЛЯ ФЕНОТИПИЧЕСКОГО АНАЛИЗА КОНФОРМАЦИОННЫХ ПЕРЕКЛЮЧЕНИЙ БЕЛКА PrP.

AU - Лашкул, В.В.

AU - Качкин, Д.В.

AU - Чернов, Ю.О.

AU - Рубель, А.А.

PY - 2019/6/18

Y1 - 2019/6/18

N2 - Целый ряд заболеваний человека и животных, получивших название амилоидозы, возникает из-за «неправильной» укладки и агрегации белков (амилоидов). В настоящее время насчитывается более 50 амилоидозов. К наиболее социально значимым амилоидозам относятся болезнь Альцгеймера, болезнь Паркинсона, боковой амиотрофический склероз, диабет II типа. В особую группу выделяют прионные заболевания (инфекционные амилоидозы), связанные с агрегацией и передачей между организмами прионного белка PrP. Подавляющее большинство амилоидных заболеваний на сегодняшний день неизлечимо. Удобным модельным объектом для изучения амилоидов млекопитающих in vivo являются дрожжи Saccharomyces cerevisiae, так как формируемые в дрожжах агрегаты в большинстве случаев не токсичны для клеток и сходны по биохимическим характеристикам с агрегатами, выявляемыми у млекопитающих [1] , [2]. Однако агрегаты амилоидных белков млекопитающих не имеют собственного фенотипического проявления в дрожжах. В нашей лаборатории разрабатывается дрожжевая модель, позволяющая по фенотипу «рост/отсутствие роста на селективных средах» оценивать амилоидогенный статус белков и проводить масштабный поиск факторов, влияющих на процессы амилоидогенеза. В качестве репортера мы используем C-терминальную последовательность дрожжевого фактора терминации трансляции - Sup35. В штаммах, маркированных нонсенс-мутацией ade1-14 и несущих делецию хромосомной копии SUP35, гибридный белок, включающий последовательность изучаемого амилоидогенного белка и репортерную последовательность, должен эффективно выполнять функции терминатора трансляции, что можно детектировать по отсутствию роста дрожжей на селективной среде без аденина. Агрегация амилоидогенного белка будет приводить к росту штаммов на селективной среде. В рамках данной работы нами разрабатывается дрожжевая модель для фенотипического анализа агрегации приона млекопитающих - PrP.Благодарности: Данная работа была выполнена при поддержке проекта 15.61.2218.2013 (СПбГУ) и ресурсных центров «ЦКП ХРОМАС» и «РМиКТ» научного парка СПбГУ.[1] Chandramowlishwaran P. et al., Mammalian amyloidogenic proteins promote prion nucleation in yeast. // 2018, J. Biol. Chem. V. 293(9), P. 3436-3450.[2] Rubel A. et al., Identification of PrP sequences essential for the interaction between the PrP polymers and Aβ peptide in a yeast-based assay. // 2013, Prion, 7(6), P. 469–476.

AB - Целый ряд заболеваний человека и животных, получивших название амилоидозы, возникает из-за «неправильной» укладки и агрегации белков (амилоидов). В настоящее время насчитывается более 50 амилоидозов. К наиболее социально значимым амилоидозам относятся болезнь Альцгеймера, болезнь Паркинсона, боковой амиотрофический склероз, диабет II типа. В особую группу выделяют прионные заболевания (инфекционные амилоидозы), связанные с агрегацией и передачей между организмами прионного белка PrP. Подавляющее большинство амилоидных заболеваний на сегодняшний день неизлечимо. Удобным модельным объектом для изучения амилоидов млекопитающих in vivo являются дрожжи Saccharomyces cerevisiae, так как формируемые в дрожжах агрегаты в большинстве случаев не токсичны для клеток и сходны по биохимическим характеристикам с агрегатами, выявляемыми у млекопитающих [1] , [2]. Однако агрегаты амилоидных белков млекопитающих не имеют собственного фенотипического проявления в дрожжах. В нашей лаборатории разрабатывается дрожжевая модель, позволяющая по фенотипу «рост/отсутствие роста на селективных средах» оценивать амилоидогенный статус белков и проводить масштабный поиск факторов, влияющих на процессы амилоидогенеза. В качестве репортера мы используем C-терминальную последовательность дрожжевого фактора терминации трансляции - Sup35. В штаммах, маркированных нонсенс-мутацией ade1-14 и несущих делецию хромосомной копии SUP35, гибридный белок, включающий последовательность изучаемого амилоидогенного белка и репортерную последовательность, должен эффективно выполнять функции терминатора трансляции, что можно детектировать по отсутствию роста дрожжей на селективной среде без аденина. Агрегация амилоидогенного белка будет приводить к росту штаммов на селективной среде. В рамках данной работы нами разрабатывается дрожжевая модель для фенотипического анализа агрегации приона млекопитающих - PrP.Благодарности: Данная работа была выполнена при поддержке проекта 15.61.2218.2013 (СПбГУ) и ресурсных центров «ЦКП ХРОМАС» и «РМиКТ» научного парка СПбГУ.[1] Chandramowlishwaran P. et al., Mammalian amyloidogenic proteins promote prion nucleation in yeast. // 2018, J. Biol. Chem. V. 293(9), P. 3436-3450.[2] Rubel A. et al., Identification of PrP sequences essential for the interaction between the PrP polymers and Aβ peptide in a yeast-based assay. // 2013, Prion, 7(6), P. 469–476.

UR - https://events.spbu.ru/eventsContent/events/2018/vogis/VII%20VSGB%20Congress%20Abstracts%202019.pdf

M3 - статья в сборнике материалов конференции

SN - 9785965112371

SP - 750

BT - VII Съезд Вавилонского общества генетиков и селекционеров (ВОГиС)

CY - СПб.

ER -

Лашкул ВВ, Качкин ДВ, Чернов ЮО, Рубель АА. РАЗРАБОТКА ДРОЖЖЕВОЙ МОДЕЛИ ДЛЯ ФЕНОТИПИЧЕСКОГО АНАЛИЗА КОНФОРМАЦИОННЫХ ПЕРЕКЛЮЧЕНИЙ БЕЛКА PrP. In VII Съезд Вавилонского общества генетиков и селекционеров (ВОГиС): Сборник тезисов. СПб. 2019. p. 750