Целью проекта является комплексное изучение истории отношений между Россией Горно-Бадахшанской автономной областью Республики Таджикистан с момента распада СССР до вывода группы пограничных войск России с территории Республики Таджикистан (2005 гг.), а также начального этапа массовой трудовой миграции из Центральной Азии в РФ. В понимании коллектива проекта понятие "комплексное исследование" многогранно. Во-первых, это использование методологического инструментария ряда родственных гуманитарных дисциплин: истории, политической науки, социальной антропологии и этнологии. Во-вторых, это создание как можно более полного (как с точки зрения объема, так и по жанровому разнообразию) корпуса источников по рассматриваемой проблеме. В-третьих, это стремление к синтезу данных, полученных "первым" и "вторым" способами.