Лаборатория "Центр биоинформатики и алгоритмической биотехнологии" в СПбГУ: 2021 г. этап 7

Project: Grant fulfilmentTotal grant fulfilment

Project Details

Description

Объектом исследования лаборатории являются геномные, транскриптомные и метаболомные данные, полученные при исследовании как отдельных организмов, так и микробных сообществ. Цель работы – создание новых алгоритмических подходов и программных инструментов для решения прикладных задач в области анализа и обработки больших объемов биологических данных.
Результатами предыдущего этапа стало создание целого ряда новых вычислительных методов и программных продуктов. Часть из них (coronaSPAdes, cloudSPAdes, metaviralSPAdes) были включены в обновленные версии разработанных ранее научным коллективом программных пакетов, в то время как остальные были выпущены как отдельные инструменты: IsoQuant, TandemTools, StringDecomposer, Nerpa и др. Наряду с предыдущими разработками лаборатории, созданные программные пакеты мгновенно получили применение в реальных биологических и медицинских исследованиях. Значимость выполненных работ подтверждается публикацией результатов исследований в высокорейтинговых международных журналах и крайне высоким уровнем их цитирования. В 2020 году сотрудники лаборатории вошли в состав трех международных консорциумов: “The Telomere-to-Telomere consortium”, “The Long-read RNA-seq Genome Annotation Assessment Project” и “Serratus” и приняли участие в ряде совместных проектов с ведущими университетами мира.
Short titleGZ-2021
AcronymMega_SPbU_2015 - 7
StatusActive
Effective start/end date1/01/2131/12/21