Projects per year
Fingerprint
Dive into the research topics where Елена Алексеевна Бушманова is active. These topic labels come from the works of this person. Together they form a unique fingerprint.
- 1 Similar Profiles
Network
Recent external collaboration on country/territory level. Dive into details by clicking on the dots or
Projects
- 9 Finished
-
Mega_SPbU_2015 - 7: Лаборатория "Центр биоинформатики и алгоритмической биотехнологии" в СПбГУ: 2021 г. этап 7
Певзнер, П. А., Лапидус, А. Л., Коробейников, А. И., Михеенко, А. А., Пржибельский, А. Д., Гуревич, А. А., Антипов, Д. Ю., Райко, М. П., Дворкина, Т. Е., Тагирджанов, А. М., Толстоганов, И. Н., Александров, И. А., Мелешко, Д. А., Шафранская, Д. Д., Бушманова, Е. А. & Кунявская, О. А.
1/01/21 → 31/12/21
Project: Grant fulfilment › Total grant fulfilment
-
RSF_RG_2019 - 3: Адаптация семейства программ SPAdes для использования новейших технологий, применяемых в анализе и сборке геномных, метагеномных и транскриптомных данных: 2021 г. этап 3
Коробейников, А. И., Лапидус, А. Л., Дворкина, Т. Е., Толстоганов, И. Н., Пржибельский, А. Д., Антипов, Д. Ю., Кунявская, О. А., Бушманова, Е. А. & Мелешко, Д. А.
1/01/21 → 31/12/21
Project: Grant fulfilment › Grant stage fulfilment
-
RFBR_Sirius_2019 - 2: Биоинформатика микробиоты: 2020 г. этап 2
Коробейников, А. И., Кунявская, О. А., Бушманова, Е. А., Шафранская, Д. Д., Тагирджанов, А. М., Пржибельский, А. Д., Лапидус, А. Л. & Гуревич, А. А.
23/11/20 → 25/10/21
Project: Grant fulfilment › Grant stage fulfilment
-
RFBR_EMBL_2018 - 3: Высокопроизводительная цепочка анализа метагеномов в EBI на базе инструментов семейства SPAdes: 2020 г. этап 3
Коробейников, А. И., Антипов, Д. Ю., Лапидус, А. Л., Пржибельский, А. Д., Бушманова, Е. А. & Кунявская, О. А.
23/09/20 → 9/09/21
Project: Grant fulfilment › Grant stage fulfilment
-
RFBR_a_2019 - 2: Analysis and de novo assembly of barcoded RNA-Seq data
Пржибельский, А. Д., Мелешко, Д. А., Антипов, Д. Ю. & Бушманова, Е. А.
27/03/20 → 26/12/20
Project: Grant fulfilment › Grant stage fulfilment
Research output
-
Extending rnaSPAdes functionality for hybrid transcriptome assembly
Prjibelski, A. D., Puglia, G. D., Antipov, D., Bushmanova, E., Giordano, D., Mikheenko, A., Vitale, D. & Lapidus, A., 24 Jul 2020, In: BMC Bioinformatics. 21, Suppl 12, p. 302 9 p., 302.Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Open Access2 Scopus citations -
Hybrid transcriptome sequencing approach improved assembly and gene annotation in Cynara cardunculus (L.)
Puglia, G. D., Prjibelski, A. D., Vitale, D., Bushmanova, E., Schmid, K. J. & Raccuia, S. A., 21 Aug 2020, In: BMC Genomics. 21, 1, 317.Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Open Access4 Scopus citations -
Extending rnaSPAdes functionality for hybrid transcriptome assembly
Prjibelski, A., Bushmanova, E., Giordano, D., Mikheenko, A., Puglia, G., Antipov, D., Viatale, D. & Lapidus, A., 8 Nov 2019, In: BMC Bioinformatics. 20, S17, 2 p., O9.Research output: Contribution to journal › Meeting Abstract › peer-review
-
RnaSPAdes: A de novo transcriptome assembler and its application to RNA-Seq data
Bushmanova, E., Antipov, D., Lapidus, A. & Prjibelski, A. D., 18 Sep 2019, In: GigaScience. 8, 9, giz100.Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Open Access115 Scopus citations -
RnaQUAST: A quality assessment tool for de novo transcriptome assemblies
Bushmanova, E., Antipov, D., Lapidus, A., Suvorov, V. & Prjibelski, A. D., 15 Jul 2016, In: Bioinformatics. 32, 14, p. 2210-2212 3 p.Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
47 Scopus citations
Activities
- 10 Oral presentation
-
Transcriptome assembly with spISO-seq data
Андрей Дмитриевич Пржибельский (Keynote speaker), Дмитрий Алексеевич Мелешко (Speaker), Елена Алексеевна Бушманова (Speaker) & Hagen Tilgner (Speaker)
28 Jul 2019Activity: Talk types › Oral presentation
-
Hybrid RNA-Seq assembly and its application to transcriptome study of Cynara cardunculus
Андрей Дмитриевич Пржибельский (Speaker) & Елена Алексеевна Бушманова (Speaker)
21 Jun 2019Activity: Talk types › Oral presentation
-
Hybrid transcriptome assembly and its application to artichoke data
Андрей Дмитриевич Пржибельский (Keynote speaker) & Елена Алексеевна Бушманова (Speaker)
20 Jun 2019Activity: Talk types › Oral presentation
-
SPAdes Family of Tools for Genome Assembly and Analysis: Current Status
Антон Иванович Коробейников (Keynote speaker), Дмитрий Юрьевич Антипов (Speaker), Елена Алексеевна Бушманова (Speaker), Алексей Александрович Гуревич (Speaker), Алла Львовна Лапидус (Speaker), Алла Александровна Михеенко (Speaker), Дмитрий Алексеевич Мелешко (Speaker), Сергей Юрьевич Нурк (Speaker), Дмитрий Алексеевич Мелешко (Speaker) & Павел Аркадьевич Певзнер (Speaker)
18 May 2018Activity: Talk types › Oral presentation
-
Гибридная сборка транскриптомов и улучшение генома артишока
Елена Алексеевна Бушманова (Speaker), Андрей Дмитриевич Пржибельский (Speaker), Giuseppe Puglia (Speaker) & Domenico Vitale (Speaker)
20 Jul 2018 → 22 Jul 2018Activity: Talk types › Oral presentation