Projects per year
Fingerprint
- 2 Similar Profiles
Network
Projects
-
RSF_RG_2019 - 3: Адаптация семейства программ SPAdes для использования новейших технологий, применяемых в анализе и сборке геномных, метагеномных и транскриптомных данных: 2021 г. этап 3
Коробейников, А. И., Лапидус, А. Л., Дворкина, Т. Е., Толстоганов, И. Н., Пржибельский, А. Д., Антипов, Д. Ю., Кунявская, О. А., Бушманова, Е. А. & Мелешко, Д. А.
1/01/21 → 31/12/21
Project
-
RFBR_Sirius_2019 - 2: Биоинформатика микробиоты: 2020 г. этап 2
Коробейников, А. И., Кунявская, О. А., Бушманова, Е. А., Шафранская, Д. Д., Тагирджанов, А. М., Пржибельский, А. Д., Лапидус, А. Л. & Гуревич, А. А.
23/11/20 → 25/10/21
Project
-
RFBR_EMBL_2018 - 3: Высокопроизводительная цепочка анализа метагеномов в EBI на базе инструментов семейства SPAdes: 2020 г. этап 3
Коробейников, А. И., Антипов, Д. Ю., Лапидус, А. Л., Пржибельский, А. Д., Бушманова, Е. А. & Кунявская, О. А.
23/09/20 → 9/09/21
Project
-
RFBR_a_2019 - 2: Analysis and de novo assembly of barcoded RNA-Seq data
Пржибельский, А. Д., Мелешко, Д. А., Антипов, Д. Ю. & Бушманова, Е. А.
27/03/20 → 26/12/20
Project
-
RSF_RG_2019 - 2: Адаптация семейства программ SPAdes для использования новейших технологий, применяемых в анализе и сборке геномных, метагеномных и транскриптомных данных: 2020 г. этап 2
Коробейников, А. И., Лапидус, А. Л., Дворкина, Т. Е., Толстоганов, И. Н., Пржибельский, А. Д., Антипов, Д. Ю., Кунявская, О. А., Бушманова, Е. А. & Мелешко, Д. А.
1/01/20 → 31/12/20
Project
Research Output
-
Extending rnaSPAdes functionality for hybrid transcriptome assembly
Prjibelski, A. D., Puglia, G. D., Antipov, D., Bushmanova, E., Giordano, D., Mikheenko, A., Vitale, D. & Lapidus, A., 24 Jul 2020, In : BMC Bioinformatics. 21, Suppl 12, p. 302 9 p., 302.Research output
Open Access -
Hybrid transcriptome sequencing approach improved assembly and gene annotation in Cynara cardunculus (L.)
Puglia, G. D., Prjibelski, A. D., Vitale, D., Bushmanova, E., Schmid, K. J. & Raccuia, S. A., 21 Aug 2020, In : BMC Genomics. 21, 1, 317.Research output
Open Access1 Citation (Scopus) -
Extending rnaSPAdes functionality for hybrid transcriptome assembly
Prjibelski, A., Bushmanova, E., Giordano, D., Mikheenko, A., Puglia, G., Antipov, D., Viatale, D. & Lapidus, A., 8 Nov 2019, In : BMC Bioinformatics. 20, S17, 2 p., O9.Research output
-
RnaSPAdes: A de novo transcriptome assembler and its application to RNA-Seq data
Bushmanova, E., Antipov, D., Lapidus, A. & Prjibelski, A. D., 18 Sep 2019, In : GigaScience. 8, 9, giz100.Research output
Open Access32 Citations (Scopus) -
RnaQUAST: A quality assessment tool for de novo transcriptome assemblies
Bushmanova, E., Antipov, D., Lapidus, A., Suvorov, V. & Prjibelski, A. D., 15 Jul 2016, In : Bioinformatics. 32, 14, p. 2210-2212 3 p.Research output
35 Citations (Scopus)
Activities
- 10 выступление с устной презентацией
-
Transcriptome assembly with spISO-seq data
Андрей Дмитриевич Пржибельский (Keynote speaker), Дмитрий Алексеевич Мелешко (Speaker), Елена Алексеевна Бушманова (Speaker) & Hagen Tilgner (Speaker)
28 Jul 2019Activity
-
Hybrid transcriptome assembly and its application to artichoke data
Андрей Дмитриевич Пржибельский (Keynote speaker) & Елена Алексеевна Бушманова (Speaker)
20 Jun 2019Activity
-
Hybrid RNA-Seq assembly and its application to transcriptome study of Cynara cardunculus
Андрей Дмитриевич Пржибельский (Speaker) & Елена Алексеевна Бушманова (Speaker)
21 Jun 2019Activity
-
SPAdes Family of Tools for Genome Assembly and Analysis: What's New?
Антон Иванович Коробейников (Keynote speaker), Дмитрий Юрьевич Антипов (Speaker), Елена Алексеевна Бушманова (Speaker), Алексей Александрович Гуревич (Speaker), Алла Львовна Лапидус (Speaker), Алла Александровна Михеенко (Speaker), Дмитрий Алексеевич Мелешко (Speaker), Сергей Юрьевич Нурк (Speaker), Андрей Дмитриевич Пржибельский (Speaker) & Павел Аркадьевич Певзнер (Speaker)
15 Feb 2018Activity
-
Hybrid transcriptome assembly and improving artichoke genome annotation
Елена Алексеевна Бушманова (Speaker), Андрей Дмитриевич Пржибельский (Speaker), Giuseppe Puglia (Speaker) & Domenico Vitale (Speaker)
16 Jul 2018 → 19 Jul 2018Activity